RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610468.4

MUC1-222, Transcript of mucin 1, cell surface associated, human

TSL 1 (best)

Gene MUC1, Length 1,162 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC1-222	ENST00000610468	GADD45A	P24522	165 aa		10.8	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	ALDH3B2	P48448	385 aa		10.8	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	OR10A3	P58181	314 aa		10.8	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	ACTB	P60709	375 aa		10.8	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF616	Q08AN1	781 aa		10.8	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	PLA2G7	Q13093	441 aa		10.8	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	GNMT	Q14749	295 aa		10.8	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	MORN2	Q502X0	79 aa		10.8	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		10.8	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		10.8	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	C22orf42	Q6IC83	251 aa		10.8	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		10.8	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		10.8	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	PRR18	Q8N4B5	295 aa		10.8	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		10.8	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		10.8	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		10.8	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468		Q96M66	194 aa		10.8	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		10.8	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	OR51J1	Q9H342	316 aa		10.8	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		10.8	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		10.8	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	STUB1	Q9UNE7	303 aa		10.8	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		10.8	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		10.79	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		10.79	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468		G3V318	75 aa		10.79	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	ATP6V0E1	O15342	81 aa		10.79	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	MGMT	P16455	207 aa		10.79	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	CD36	P16671	472 aa		10.79	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	FUT3	P21217	361 aa		10.79	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	GNB1	P62873	340 aa		10.79	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	UNC119	Q13432	240 aa		10.79	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		10.79	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		10.79	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		10.79	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	RITA1	Q96K30	269 aa		10.79	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	ASCL2	Q99929	193 aa		10.79	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	NABP2	Q9BQ15	211 aa		10.79	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	CENPO	Q9BU64	300 aa		10.79	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	KCNK15	Q9H427	330 aa		10.79	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	BATF3	Q9NR55	127 aa		10.79	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	JPT1	Q9UK76	154 aa		10.79	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		10.79	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		10.79	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468		A0A0A6YYD4	124 aa		10.78	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	SLC17A2	O00624	439 aa		10.78	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	ARL6IP5	O75915	188 aa		10.78	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	NDUFA3	O95167	84 aa		10.78	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	TGFBR1	P36897	503 aa		10.78	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	HTD2	P86397	168 aa		10.78	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		10.78	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	AWAT2	Q6E213	333 aa		10.78	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	OR10K2	Q6IF99	312 aa		10.78	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM65	Q6PI78	240 aa		10.78	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		10.78	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF429	Q86V71	674 aa		10.78	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	NPB	Q8NG41	125 aa		10.78	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		10.78	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	BANF2	Q9H503	90 aa		10.78	□□□□□ -0.68
MUC1-222	ENST00000610468	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		10.77	□□□□□ -0.69
MUC1-222	ENST00000610468	NBR2	O15453	112 aa		10.77	□□□□□ -0.69
MUC1-222	ENST00000610468	YPEL1	O60688	119 aa		10.77	□□□□□ -0.69
MUC1-222	ENST00000610468	PDCD6	O75340	191 aa		10.77	□□□□□ -0.69
MUC1-222	ENST00000610468	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		10.77	□□□□□ -0.69
MUC1-222	ENST00000610468	CNTFR	P26992	372 aa		10.77	□□□□□ -0.69
MUC1-222	ENST00000610468	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
MUC1-222	ENST00000610468	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
MUC1-222	ENST00000610468	RAB9A	P51151	201 aa		10.77	□□□□□ -0.69
MUC1-222	ENST00000610468	NDP	Q00604	133 aa		10.77	□□□□□ -0.69
MUC1-222	ENST00000610468	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		10.77	□□□□□ -0.69
MUC1-222	ENST00000610468	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
MUC1-222	ENST00000610468	YPEL2	Q96QA6	119 aa		10.77	□□□□□ -0.69
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		10.77	□□□□□ -0.69
MUC1-222	ENST00000610468	TM2D1	Q9BX74	207 aa		10.77	□□□□□ -0.69
MUC1-222	ENST00000610468	PARP11	Q9NR21	331 aa		10.77	□□□□□ -0.69
MUC1-222	ENST00000610468	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		10.77	□□□□□ -0.69
MUC1-222	ENST00000610468	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		10.76	□□□□□ -0.69
MUC1-222	ENST00000610468	UBE2QL1	A1L167	161 aa		10.76	□□□□□ -0.69
MUC1-222	ENST00000610468	SOX15	O60248	233 aa		10.76	□□□□□ -0.69
MUC1-222	ENST00000610468	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
MUC1-222	ENST00000610468	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
MUC1-222	ENST00000610468	HTR2C	P28335	458 aa		10.76	□□□□□ -0.69
MUC1-222	ENST00000610468	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		10.76	□□□□□ -0.69
MUC1-222	ENST00000610468	LIN54	Q6MZP7	749 aa		10.76	□□□□□ -0.69
MUC1-222	ENST00000610468	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		10.76	□□□□□ -0.69
MUC1-222	ENST00000610468	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		10.76	□□□□□ -0.69
MUC1-222	ENST00000610468	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		10.76	□□□□□ -0.69
MUC1-222	ENST00000610468	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		10.76	□□□□□ -0.69
MUC1-222	ENST00000610468	MUC7	Q8TAX7	377 aa		10.76	□□□□□ -0.69
MUC1-222	ENST00000610468	DCUN1D4	Q92564	292 aa		10.76	□□□□□ -0.69
MUC1-222	ENST00000610468	OR5B12	Q96R08	314 aa		10.76	□□□□□ -0.69
MUC1-222	ENST00000610468	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
MUC1-222	ENST00000610468	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		10.76	□□□□□ -0.69

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