RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594387.1

IRF3-208, Transcript of interferon regulatory factor 3, human

TSL 3

Gene IRF3, Length 800 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IRF3-208	ENST00000594387	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		13.74	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	ZNF329	Q86UD4	541 aa		13.74	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		13.74	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	STPG2	Q8N412	459 aa		13.74	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		13.73	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	SHISA3	A0PJX4	238 aa		13.73	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	SCGN	O76038	276 aa		13.73	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	SCT	P09683	121 aa		13.73	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	ACTB	P60709	375 aa		13.73	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	TEX38	Q6PEX7	206 aa		13.73	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		13.73	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		13.73	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	NABP2	Q9BQ15	211 aa		13.73	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		13.73	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		13.73	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	ZFP57	Q9NU63	452 aa		13.73	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		13.73	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		13.72	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	SMIM30	A4D0T7	59 aa		13.72	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	OR5H14	A6NHG9	310 aa		13.72	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		13.72	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	NUDT19	A8MXV4	375 aa		13.72	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387		H7C2Y5	167 aa		13.72	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	GNB3	P16520	340 aa		13.72	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	VDAC1	P21796	283 aa		13.72	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	F2RL1	P55085	397 aa		13.72	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		13.72	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	C1QL4	Q86Z23	238 aa		13.72	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		13.72	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		13.72	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		13.72	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	RAB27B	O00194	218 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	NBR2	O15453	112 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	FABP7	O15540	132 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	WIPF1	O43516	503 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	OR5H8	P0DN80	308 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	CD36	P16671	472 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	SLC6A1	P30531	599 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	PLA2G7	Q13093	441 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	PLGLA	Q15195	96 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	OR51E2	Q9H255	320 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387	RNF150	Q9ULK6	438 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IRF3-208	ENST00000594387		A0A0B4J203	849 aa		13.7	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387	BET1	O15155	118 aa		13.7	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387	RBBP9	O75884	186 aa		13.7	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387	FCGR3A	P08637	254 aa		13.7	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387	SDC2	P34741	201 aa		13.7	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387	MXD1	Q05195	221 aa		13.7	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		13.7	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387	LIN54	Q6MZP7	749 aa		13.7	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387		Q6ZPA2	131 aa		13.7	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		13.7	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387	GINS4	Q9BRT9	223 aa		13.7	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387	RDH8	Q9NYR8	311 aa		13.7	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		13.7	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387		A0A087WXM4	84 aa		13.69	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387	LINC01548	A6NM66	108 aa		13.69	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387	MFNG	O00587	321 aa		13.69	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387	TNFAIP8	O95379	198 aa		13.69	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387	APOA2	P02652	100 aa		13.69	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387	PITPNA	Q00169	270 aa		13.69	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387	CDNF	Q49AH0	187 aa		13.69	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		13.69	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		13.69	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		13.69	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387		G3V4G9	280 aa		13.68	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387	DIRAS3	O95661	229 aa		13.68	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387	TFAP2A	P05549	437 aa		13.68	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387	GSTT2	P0CG29	244 aa		13.68	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387	GSTT2B	P0CG30	244 aa		13.68	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387	CT45A6	P0DMU7	189 aa		13.68	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387	CT45A5	P0DMU8	189 aa		13.68	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387	CT45A7	P0DMV0	189 aa		13.68	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387	SCAND1	P57086	179 aa		13.68	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387	CBX3	Q13185	183 aa		13.68	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	13.68	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387	IDNK	Q5T6J7	187 aa		13.68	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		13.68	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		13.68	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		13.68	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387	NPB	Q8NG41	125 aa		13.68	□□□□□ -0.22
IRF3-208	ENST00000594387	RNF5	Q99942	180 aa		13.68	□□□□□ -0.22

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