RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555855.5

FOXN3-211, Transcript of forkhead box N3, humanhuman

TSL 5

Gene FOXN3, Length 851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-211ENST00000555855 IGLV1-51P01701 117 aa14.92□□□□□ -0.02
FOXN3-211ENST00000555855 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
FOXN3-211ENST00000555855 ARSBP15848 533 aa14.92□□□□□ -0.02
FOXN3-211ENST00000555855 MC5RP33032 325 aa14.92□□□□□ -0.02
FOXN3-211ENST00000555855 FAM71F2Q6NXP2 309 aa14.92□□□□□ -0.02
FOXN3-211ENST00000555855 C5orf24Q7Z6I8 188 aa14.92□□□□□ -0.02
FOXN3-211ENST00000555855 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
FOXN3-211ENST00000555855 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
FOXN3-211ENST00000555855 TNCP24821 2201 aa14.91□□□□□ -0.02
FOXN3-211ENST00000555855 H7C2Y5 167 aa14.91□□□□□ -0.02
FOXN3-211ENST00000555855 FCN1O00602 326 aa14.91□□□□□ -0.02
FOXN3-211ENST00000555855 RAB29O14966 203 aa14.91□□□□□ -0.02
FOXN3-211ENST00000555855 YIF1BQ5BJH7 314 aa14.91□□□□□ -0.02
FOXN3-211ENST00000555855 FAM131AQ6UXB0 335 aa14.91□□□□□ -0.02
FOXN3-211ENST00000555855 HAPLN4Q86UW8 402 aa14.91□□□□□ -0.02
FOXN3-211ENST00000555855 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
FOXN3-211ENST00000555855 RDH12Q96NR8 316 aa14.91□□□□□ -0.02
FOXN3-211ENST00000555855 CLCC1Q96S66 551 aa14.91□□□□□ -0.02
FOXN3-211ENST00000555855 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa14.9□□□□□ -0.02
FOXN3-211ENST00000555855 A0A1W2PPK0 400 aa14.9□□□□□ -0.02
FOXN3-211ENST00000555855 IRGMA1A4Y4 181 aa14.9□□□□□ -0.02
FOXN3-211ENST00000555855 OR5H14A6NHG9 310 aa14.9□□□□□ -0.02
FOXN3-211ENST00000555855 H0Y980 276 aa14.9□□□□□ -0.02
FOXN3-211ENST00000555855 PDCD6O75340 191 aa14.9□□□□□ -0.02
FOXN3-211ENST00000555855 RBBP9O75884 186 aa14.9□□□□□ -0.02
FOXN3-211ENST00000555855 JTBO76095 146 aa14.9□□□□□ -0.02
FOXN3-211ENST00000555855 BAG2O95816 211 aa14.9□□□□□ -0.02
FOXN3-211ENST00000555855 TRGV3P03979 118 aa14.9□□□□□ -0.02
FOXN3-211ENST00000555855 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
FOXN3-211ENST00000555855 MYL12AP19105 171 aa14.9□□□□□ -0.02
FOXN3-211ENST00000555855 ZP3P21754 424 aa14.9□□□□□ -0.02
FOXN3-211ENST00000555855 CAPGP40121 348 aa14.9□□□□□ -0.02
FOXN3-211ENST00000555855 MED21Q13503 144 aa14.9□□□□□ -0.02
FOXN3-211ENST00000555855 LFNGQ8NES3 379 aa14.9□□□□□ -0.02
FOXN3-211ENST00000555855 Q96M66 194 aa14.9□□□□□ -0.02
FOXN3-211ENST00000555855 NEDD4LQ96PU5 975 aa14.9□□□□□ -0.02
FOXN3-211ENST00000555855 RNF5Q99942 180 aa14.9□□□□□ -0.02
FOXN3-211ENST00000555855 C9orf16Q9BUW7 83 aa14.9□□□□□ -0.02
FOXN3-211ENST00000555855 TUBA4BQ9H853 241 aa14.9□□□□□ -0.02
FOXN3-211ENST00000555855 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa14.9□□□□□ -0.02
FOXN3-211ENST00000555855 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
FOXN3-211ENST00000555855 TFAP2AP05549 437 aa14.89□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 CT45A6P0DMU7 189 aa14.89□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 CT45A5P0DMU8 189 aa14.89□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 CT45A7P0DMV0 189 aa14.89□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 FSTP19883 344 aa14.89□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 HAGHQ16775 308 aa14.89□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 SIGIRRQ6IA17 410 aa14.89□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 ZFP1Q6P2D0 407 aa14.89□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 ZNF562Q6V9R5 426 aa14.89□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 IL17DQ8TAD2 202 aa14.89□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 IL1F10Q8WWZ1 152 aa14.89□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 LYSTQ99698 3801 aa14.89□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa14.88□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 ST8SIA5O15466 376 aa14.88□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 APH1BQ8WW43 257 aa14.88□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 IFI27L2Q9H2X8 130 aa14.88□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 GHRLQ9UBU3 117 aa14.88□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 GAB2Q9UQC2 676 aa14.88□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 WASHC3Q9Y3C0 194 aa14.88□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa14.87□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 A0A0G2JLM5 398 aa14.87□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 HMGN3Q15651 99 aa14.87□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 TATDN3Q17R31 274 aa14.87□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 RPL39P5Q59GN2 51 aa14.87□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 C10orf67Q8IYJ2 551 aa14.87□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 FAM46BQ96A09 425 aa14.87□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 OR14A2Q96R54 314 aa14.87□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 SLC29A1Q99808 456 aa14.87□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 TMED9Q9BVK6 235 aa14.87□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 SLC23A1Q9UHI7 598 aa14.87□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 STARD9Q9P2P6 4700 aa14.87□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 H0YJW9 148 aa14.86□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 H3BNX3 289 aa14.86□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 SLC22A1O15245 554 aa14.86□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 LALBAP00709 142 aa14.86□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 PSG5Q15238 335 aa14.86□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 MOGAT2Q3SYC2 334 aa14.86□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 C6orf141Q5SZD1 244 aa14.86□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 GTSCR1Q86UQ5 136 aa14.86□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 ZFP41Q8N8Y5 198 aa14.86□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 ZNF555Q8NEP9 628 aa14.86□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 UQCC2Q9BRT2 126 aa14.86□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 FAAP24Q9BTP7 215 aa14.86□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 CLEC2DQ9UHP7 191 aa14.86□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 ANKRD34BA5PLL1 514 aa14.85□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 WBP4O75554 376 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 CA2P00918 260 aa14.85□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 RPS16P62249 146 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 NKAIN3Q8N8D7 197 aa14.85□□□□□ -0.03
FOXN3-211ENST00000555855 OR5AN1Q8NGI8 311 aa14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.1 ms