RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 ERGIC1Q969X5 290 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 AQP10Q96PS8 301 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 SYT3Q9BQG1 590 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 SLC5A7Q9GZV3 580 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 CDH20Q9HBT6 801 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 DECR2Q9NUI1 292 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 FZR1Q9UM11 496 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 AKAP13Q12802 2813 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 IFITM10A6NMD0 228 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 NUDT19A8MXV4 375 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 SIRPB1O00241 398 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 NXPH2O95156 264 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 IGHV1-2P23083 117 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 GNRHRP30968 328 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 HERPUD1Q15011 391 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 VWA1Q6PCB0 445 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 LIAT1Q6ZQX7 453 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 FAM58AQ8N1B3 248 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 GAPTQ8N292 157 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 SLC35G3Q8N808 338 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 OR4A4PQ8NGN8 299 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 MAGT1Q9H0U3 335 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 TAF9BQ9HBM6 251 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 Q9N2K0 584 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 MMP26Q9NRE1 261 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 CCL28Q9NRJ3 127 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 LUZP4Q9P127 313 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 PLCE1Q9P212 2302 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 CUL9Q8IWT3 2517 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 CYSRT1A8MQ03 144 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 MPPED1O15442 326 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 OR2C1O95371 312 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 IL2RGP31785 369 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 TBC1D28Q2M2D7 210 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 LRP11Q86VZ4 500 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 ZNF573Q86YE8 665 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 LGI3Q8N145 548 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 ZNF664Q8N3J9 261 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 ZNF610Q8N9Z0 462 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 EGLN1Q9GZT9 426 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 SPTA1P02549 2419 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 CEP295Q9C0D2 2601 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 USF3Q68DE3 2245 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 NKX2-6A6NCS4 301 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 CDIPTO14735 213 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 DEDDO75618 318 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 OMGP23515 440 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 OR3A1P47881 315 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 CEBPGP53567 150 aa5.92□□□□□ -1.46
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HERC4-211ENST00000492996 TBC1D26Q86UD7 250 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 OR1J1Q8NGS3 322 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 SLC25A40Q8TBP6 338 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 GALNT14Q96FL9 552 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 TRAV24A0A0B4J272 114 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 H0YL77 283 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 OVOL3O00110 214 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 DEGS1O15121 323 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 NAPSAO96009 420 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 TFF1P04155 84 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 LYL1P12980 280 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 PTTG1IPP53801 180 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 FOXF2Q12947 444 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 RHEBQ15382 184 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 CFAP161Q6P656 301 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 WDR86Q86TI4 376 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 ZNF695Q8IW36 515 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 OR10A7Q8NGE5 316 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 OR51H1Q8NH63 302 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 MPC1Q9Y5U8 109 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 KPTNQ9Y664 436 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 NBASA2RRP1 2371 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 A0A1B0GV50 99 aa5.91□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 ITGB1BP1O14713 200 aa5.91□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 METTL15P1P0C7V9 234 aa5.91□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 FAM157CP0CG43 387 aa5.91□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 SULT1A1P50225 295 aa5.91□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 HNF4GQ14541 408 aa5.91□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa5.91□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 ZNF826PQ6ZT77 177 aa5.91□□□□□ -1.46
HERC4-211ENST00000492996 FAM214BQ7L5A3 538 aa5.91□□□□□ -1.46
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