RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477970.1

PTPRF-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRF, Length 3,321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-212ENST00000477970 HSPB7Q9UBY9 170 aa10.22□□□□□ -0.77
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PTPRF-212ENST00000477970 A6NLC8 198 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRF-212ENST00000477970 GATA4P43694 442 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
PTPRF-212ENST00000477970 FGFRL1Q8N441 504 aa10.22□□□□□ -0.77
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PTPRF-212ENST00000477970 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
PTPRF-212ENST00000477970 FAM213BQ8TBF2 198 aa10.22□□□□□ -0.77
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PTPRF-212ENST00000477970 ATP6V1FQ16864 119 aa10.19□□□□□ -0.78
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PTPRF-212ENST00000477970 SSX8Q7RTT4 187 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRF-212ENST00000477970 OR2Z1Q8NG97 314 aa10.19□□□□□ -0.78
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