RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476612.1

UBE2Q1-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2Q1, Length 301 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-204ENST00000476612 RNF150Q9ULK6 438 aa3.12□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 GAB2Q9UQC2 676 aa3.12□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 FBXO7Q9Y3I1 522 aa3.12□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 PSMB11A5LHX3 300 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 TRIM64CA6NLI5 447 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 SERPINE3A8MV23 424 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 TRDCB7Z8K6 153 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 G3V318 75 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 H0YJW9 148 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 M0QZK8 103 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 ITGB1BP1O14713 200 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 SSX5O60225 188 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 SOX15O60248 233 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 NDUFA3O95167 84 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 IGLV2-14P01704 120 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 IGKV1-16P04430 117 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 CRYGBP07316 175 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 FCGR3AP08637 254 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 PTHLHP12272 177 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 RAB3BP20337 219 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 PSMB9P28065 219 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 PPIFP30405 207 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 SDC2P34741 201 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 PSMD7P51665 324 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 BRWD1-AS2P59051 145 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 ACTBP60709 375 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 CX3CL1P78423 397 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 HLA-DRB3P79483 266 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 NDPQ00604 133 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 PJVKQ0ZLH3 352 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 TMEM30BQ3MIR4 351 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZNF260Q3ZCT1 412 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 FOXB2Q5VYV0 432 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 TRAT1Q6PIZ9 186 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZNF773Q6PK81 442 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 SLC35E3Q7Z769 313 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 STPG2Q8N412 459 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 LINC00482Q8N8I6 264 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 RNF152Q8N8N0 203 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 ZNF383Q8NA42 475 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 NPBQ8NG41 125 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 OR56B1Q8NGI3 324 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 OR5AN1Q8NGI8 311 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 SETD6Q8TBK2 473 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 MYOZ3Q8TDC0 251 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 PHF21AQ96BD5 680 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 SLC25A38Q96DW6 304 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 YIPF6Q96EC8 236 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 AKR1E2Q96JD6 320 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 DUX3Q96PT4 197 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 P2RX4Q99571 388 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 TOLLIPQ9H0E2 274 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 RDH8Q9NYR8 311 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 KCNIP1Q9NZI2 227 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 SLC23A1Q9UHI7 598 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 WSB1Q9Y6I7 421 aa3.11□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa3.1□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa3.1□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 LINC00473A8K010 186 aa3.1□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 NOTOA8MTQ0 251 aa3.1□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 H3BUI4 141 aa3.1□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 PDCD5O14737 125 aa3.1□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 RAB29O14966 203 aa3.1□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 FABP7O15540 132 aa3.1□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 IGLV1-40P01703 118 aa3.1□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 IGLV2-23P01705 113 aa3.1□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 IGHG4P01861 327 aa3.1□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 IGF1P05019 195 aa3.1□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 OR8U9P0C7N5 309 aa3.1□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 IGKV1-13P0DP09 117 aa3.1□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 CD36P16671 472 aa3.1□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 RAB6AP20340 208 aa3.1□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 IL3RAP26951 378 aa3.1□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 PSMB8P28062 276 aa3.1□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 SOX6P35712 828 aa3.1□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 RPS19P39019 145 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 THBS3P49746 956 aa3.1□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 ARHGDIBP52566 201 aa3.1□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 RPL30P62888 115 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 MXD1Q05195 221 aa3.1□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 FOXE3Q13461 319 aa3.1□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 PSG5Q15238 335 aa3.1□□□□□ -1.91
UBE2Q1-204ENST00000476612 MMDQ15546 238 aa3.1□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.3 ms