RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472420.5

LRPPRC-208, Transcript of leucine rich pentatricopeptide repeat containing, human

TSL 2

Gene LRPPRC, Length 694 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRPPRC-208	ENST00000472420	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	ARL11	Q969Q4	196 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	ALG8	Q9BVK2	526 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	TMEM189	A5PLL7	270 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420		A6NIN4	97 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	FFAR1	O14842	300 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	RBBP9	O75884	186 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	SPP1	P10451	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	C4BPB	P20851	252 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	OMP	P47874	163 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	FUT6	P51993	359 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	SLC18A1	P54219	525 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	CLINT1	Q14677	625 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	PSG5	Q15238	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	C15orf32	Q32M92	178 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	SPDL1	Q96EA4	605 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	UPK3B	Q9BT76	320 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	OR52D1	Q9H346	318 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	DKK2	Q9UBU2	259 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420		V9GYS6	101 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420		J3KTA2	159 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	SULT1B1	O43704	296 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	KDM4B	O94953	1096 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	PRH1	P02810	166 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	GYPB	P06028	91 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	LYN	P07948	512 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	OR9G9	P0C7N8	305 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	BLVRA	P53004	296 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	EMP1	P54849	157 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	CD300C	Q08708	224 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	SHF	Q7M4L6	423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	STH	Q8IWL8	128 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	PRR18	Q8N4B5	295 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	BORCS8	Q96FH0	119 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	INTS14	Q96SY0	518 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	RNF5	Q99942	180 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	FAM206A	Q9NX38	181 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	GNG12	Q9UBI6	72 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	UBE2QL1	A1L167	161 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420		H0YJX3	145 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	E2F6	O75461	281 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	KRT36	O76013	467 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	SPDEF	O95238	335 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	ZNF682	O95780	498 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	APELA	P0DMC3	54 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	TFPI2	P48307	235 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	KCNJ3	P48549	501 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	ODF1	Q14990	250 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	UBE2V2	Q15819	145 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420		Q6ZRU5	148 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	SCX	Q7RTU7	201 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	NFE4	Q86UQ8	179 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	APOPT1	Q96IL0	206 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	GPHA2	Q96T91	129 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	FMO2	Q99518	471 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	HSF4	Q9ULV5	492 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LRPPRC-208	ENST00000472420	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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