RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444498.5

NME4-205, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 3

Gene NME4, Length 1,111 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-205ENST00000444498 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
NME4-205ENST00000444498 CEACAM6P40199 344 aa14.79□□□□□ -0.04
NME4-205ENST00000444498 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
NME4-205ENST00000444498 STPG2Q8N412 459 aa14.79□□□□□ -0.04
NME4-205ENST00000444498 EDARADDQ8WWZ3 215 aa14.79□□□□□ -0.04
NME4-205ENST00000444498 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
NME4-205ENST00000444498 ZNF251Q9BRH9 671 aa14.79□□□□□ -0.04
NME4-205ENST00000444498 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
NME4-205ENST00000444498 OR1A1Q9P1Q5 309 aa14.79□□□□□ -0.04
NME4-205ENST00000444498 SMIM30A4D0T7 59 aa14.78□□□□□ -0.04
NME4-205ENST00000444498 AP4M1O00189 453 aa14.78□□□□□ -0.04
NME4-205ENST00000444498 MFNGO00587 321 aa14.78□□□□□ -0.04
NME4-205ENST00000444498 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
NME4-205ENST00000444498 GNB3P16520 340 aa14.78□□□□□ -0.04
NME4-205ENST00000444498 SLC35B1P78383 322 aa14.78□□□□□ -0.04
NME4-205ENST00000444498 C1QL4Q86Z23 238 aa14.78□□□□□ -0.04
NME4-205ENST00000444498 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
NME4-205ENST00000444498 OR51E2Q9H255 320 aa14.78□□□□□ -0.04
NME4-205ENST00000444498 LINC00527Q9UJ94 153 aa14.78□□□□□ -0.04
NME4-205ENST00000444498 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa14.77□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 FCGR3AP08637 254 aa14.77□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 PF4V1P10720 104 aa14.77□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 SOX6P35712 828 aa14.77□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 ACTBP60709 375 aa14.77□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 MMDQ15546 238 aa14.77□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 NEDD8Q15843 81 aa14.77□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 RPL39P5Q59GN2 51 aa14.77□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa14.77□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 COMMD1Q8N668 190 aa14.77□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 OR4A4PQ8NGN8 299 aa14.77□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 KCTD7Q96MP8 289 aa14.77□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 G3V4G9 280 aa14.76□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 PLXNB1O43157 2135 aa14.76□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 CT45A6P0DMU7 189 aa14.76□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 CT45A5P0DMU8 189 aa14.76□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 CT45A7P0DMV0 189 aa14.76□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 SDC2P34741 201 aa14.76□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 SERPINB10P48595 397 aa14.76□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 KIR2DS1Q14954 304 aa14.76□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 SAMD5Q5TGI4 173 aa14.76□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 PHF21AQ96BD5 680 aa14.76□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 ABHD14BQ96IU4 210 aa14.76□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 RITA1Q96K30 269 aa14.76□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 HSPB9Q9BQS6 159 aa14.76□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa14.76□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 GON7Q9BXV9 100 aa14.76□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 ATG5Q9H1Y0 275 aa14.76□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 A0A075B6Q4 140 aa14.75□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 OR5H14A6NHG9 310 aa14.75□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 FABP7O15540 132 aa14.75□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 DIRAS3O95661 229 aa14.75□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 CD36P16671 472 aa14.75□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 ARL6IP1Q15041 203 aa14.75□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 SFXN4Q6P4A7 337 aa14.75□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 WFDC9Q8NEX5 89 aa14.75□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 TOLLIPQ9H0E2 274 aa14.75□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 ZFP57Q9NU63 452 aa14.75□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 RDH8Q9NYR8 311 aa14.75□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 DAPK2Q9UIK4 370 aa14.75□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 ZNF580Q9UK33 172 aa14.75□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 NOTCH3Q9UM47 2321 aa14.75□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa14.74□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 NBR2O15453 112 aa14.74□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 RRP9O43818 475 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 MC5RP33032 325 aa14.74□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa14.74□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 BEAN1Q3B7T3 259 aa14.74□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 TEX38Q6PEX7 206 aa14.74□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 FAM131AQ6UXB0 335 aa14.74□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 NPBQ8NG41 125 aa14.74□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 OR5AN1Q8NGI8 311 aa14.74□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 CABLES2Q9BTV7 478 aa14.74□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 RNF167Q9H6Y7 350 aa14.74□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 H0YJW9 148 aa14.73□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 PROP1O75360 226 aa14.73□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 PF4P02776 101 aa14.73□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 IGF1P05019 195 aa14.73□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 GSTT2P0CG29 244 aa14.73□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 GSTT2BP0CG30 244 aa14.73□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 CNTFRP26992 372 aa14.73□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 SLC6A1P30531 599 aa14.73□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 TALDO1P37837 337 aa14.73□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 ARFRP1Q13795 201 aa14.73□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 IGSF11Q5DX21 431 aa14.73□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 Q6ZS49 121 aa14.73□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 CENPOQ9BU64 300 aa14.73□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 ZNF221Q9UK13 617 aa14.73□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 RNF150Q9ULK6 438 aa14.73□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa14.72□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 BET1O15155 118 aa14.72□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 SCGNO76038 276 aa14.72□□□□□ -0.05
NME4-205ENST00000444498 NDUFA3O95167 84 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms