RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 FAM90A2PQ658T7 463 aa22.21■■□□□ 1.15
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HOXD13-201ENST00000392539 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD13-201ENST00000392539 COL6A3P12111 3177 aa22.16■■□□□ 1.14
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HOXD13-201ENST00000392539 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa22.15■■□□□ 1.14
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HOXD13-201ENST00000392539 NCMAPQ5T1S8 102 aa22.14■■□□□ 1.14
HOXD13-201ENST00000392539 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
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HOXD13-201ENST00000392539 IGKV3-15P01624 115 aa22.14■■□□□ 1.13
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HOXD13-201ENST00000392539 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
HOXD13-201ENST00000392539 OR2B11Q5JQS5 317 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD13-201ENST00000392539 FAM180AQ6UWF9 173 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD13-201ENST00000392539 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD13-201ENST00000392539 SDF2L1Q9HCN8 221 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD13-201ENST00000392539 WDFY4Q6ZS81 3184 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD13-201ENST00000392539 ODAMA1E959 279 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
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