RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373159.1

TRAPPC3-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-201ENST00000373159 CT45A7P0DMV0 189 aa10.05□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP10.05□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 LRRC36Q1X8D7 754 aa10.05□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 C6orf141Q5SZD1 244 aa10.05□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 AWAT2Q6E213 333 aa10.05□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 CASTOR1Q8WTX7 329 aa10.05□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 ISOC1Q96CN7 298 aa10.05□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 CYYR1Q96J86 154 aa10.05□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 PGLYRP3Q96LB9 341 aa10.05□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 OR14A2Q96R54 314 aa10.05□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 RNF5Q99942 180 aa10.05□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 ELOVL1Q9BW60 279 aa10.05□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 IFI27L2Q9H2X8 130 aa10.05□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 FBXL15Q9H469 300 aa10.05□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 PIPOXQ9P0Z9 390 aa10.05□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 STUB1Q9UNE7 303 aa10.05□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 IRGMA1A4Y4 181 aa10.04□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 RAB29O14966 203 aa10.04□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 HSPA12AO43301 675 aa10.04□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 IGLV1-51P01701 117 aa10.04□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 IGHV3-11P01762 117 aa10.04□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 CD40LGP29965 261 aa10.04□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 MC5RP33032 325 aa10.04□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 ACTBL2Q562R1 376 aa10.04□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 FAM131AQ6UXB0 335 aa10.04□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZNF562Q6V9R5 426 aa10.04□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 PPP1R27Q86WC6 154 aa10.04□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 SGPP2Q8IWX5 399 aa10.04□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZNF485Q8NCK3 441 aa10.04□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 SLA2Q9H6Q3 261 aa10.04□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 FAM53CQ9NYF3 392 aa10.04□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 GHRLQ9UBU3 117 aa10.04□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 CLEC2DQ9UHP7 191 aa10.04□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 A3GALT2U3KPV4 340 aa10.04□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 A0A1W2PPK0 400 aa10.03□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 OR5H14A6NHG9 310 aa10.03□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 RBBP9O75884 186 aa10.03□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 BAG2O95816 211 aa10.03□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 MYL12AP19105 171 aa10.03□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 CAPGP40121 348 aa10.03□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 PLGLAQ15195 96 aa10.03□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 HMGN3Q15651 99 aa10.03□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa10.03□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 C10orf67Q8IYJ2 551 aa10.03□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 OR5AN1Q8NGI8 311 aa10.03□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 MS4A10Q96PG2 267 aa10.03□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 UQCC2Q9BRT2 126 aa10.03□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 ABRACLQ9P1F3 81 aa10.03□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 STEAP1Q9UHE8 339 aa10.03□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 SLC23A1Q9UHI7 598 aa10.03□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 GAB2Q9UQC2 676 aa10.03□□□□□ -0.8
TRAPPC3-201ENST00000373159 H0YJW9 148 aa10.02□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 ITGB1BP1O14713 200 aa10.02□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 ST8SIA5O15466 376 aa10.02□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 TFAP2AP05549 437 aa10.02□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 TPPP2P59282 170 aa10.02□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 RPL39P5Q59GN2 51 aa10.02□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 HAPLN4Q86UW8 402 aa10.02□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa10.02□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 LFNGQ8NES3 379 aa10.02□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 ABHD5Q8WTS1 349 aa10.02□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 TMEM80Q96HE8 168 aa10.02□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 NEDD4LQ96PU5 975 aa10.02□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 SULT4A1Q9BR01 284 aa10.02□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 SPATA25Q9BR10 227 aa10.02□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 AGMATQ9BSE5 352 aa10.02□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 WASHC3Q9Y3C0 194 aa10.02□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 CD1AP06126 327 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZP3P21754 424 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 MED21Q13503 144 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 PSG5Q15238 335 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 HAGHQ16775 308 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 NKAIN3Q8N8D7 197 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZFP41Q8N8Y5 198 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZNF555Q8NEP9 628 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 IL1F10Q8WWZ1 152 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 FAM46BQ96A09 425 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 DERL3Q96Q80 235 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 FAAP24Q9BTP7 215 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 H0Y980 276 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 H7C2Y5 167 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 NAPSAO96009 420 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 TRGV3P03979 118 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 IFNA6P05013 189 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 UBBP0CG47 229 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 ARSBP15848 533 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 TAS2R43P59537 309 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZNF880Q6PDB4 577 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 IL34Q6ZMJ4 242 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC3-201ENST00000373159 CLCC1Q96S66 551 aa10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms