RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 AGMATQ9BSE5 352 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATG5Q9H1Y0 275 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIPOXQ9P0Z9 390 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSMB11A5LHX3 300 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 SERPINE3A8MV23 424 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB29O14966 203 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 HSPA12AO43301 675 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 CEACAM6P40199 344 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR12P47775 334 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 F2RL1P55085 397 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSPAN14Q8NG11 270 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR4X2Q8NGF9 303 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR4A4PQ8NGN8 299 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 EDARADDQ8WWZ3 215 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABHD14BQ96IU4 210 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABCG5Q9H222 651 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLXNB1O43157 2135 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A087WXM4 84 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1W2PRX2 142 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 LINC01548A6NM66 108 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 FABP7O15540 132 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 OPN1MWP04001 364 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 OPN1MW2P0DN77 364 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 OPN1MW3P0DN78 364 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAFIPQ8WZ33 124 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 R3HDM4Q96D70 268 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 RITA1Q96K30 269 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 CABLES2Q9BTV7 478 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 LINC00527Q9UJ94 153 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 NOTCH3Q9UM47 2321 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACTBP60709 375 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARFRP1Q13795 201 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIR2DS1Q14954 304 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 MMDQ15546 238 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF329Q86UD4 541 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 FOXRED2Q8IWF2 684 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR4F17Q8NGA8 305 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHPT1Q8WUD6 406 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 YIPF6Q96EC8 236 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR4F4Q96R69 305 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 RASL11BQ9BPW5 248 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 TOLLIPQ9H0E2 274 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 RDH8Q9NYR8 311 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 GSTT2P0CG29 244 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 GSTT2BP0CG30 244 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 CT45A6P0DMU7 189 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 CT45A5P0DMU8 189 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 CT45A7P0DMV0 189 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 CNTFRP26992 372 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 SERPINB10P48595 397 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARL6IP1Q15041 203 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGSF11Q5DX21 431 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM131AQ6UXB0 335 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 STPG2Q8N412 459 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 HSPB9Q9BQS6 159 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 GHITMQ9H3K2 345 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 VCX3AQ9NNX9 186 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 RHBDL2Q9NX52 303 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM64CA6NLI5 447 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 AP4M1O00189 453 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNAB3O43448 404 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 WIPF1O43516 503 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 PROP1O75360 226 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 DIRAS3O95661 229 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 TGFBR1P36897 503 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCAND1P57086 179 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDNFQ49AH0 187 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 IDNKQ5T6J7 187 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q6ZS49 121 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR5H6Q8NGV6 325 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC25A38Q96DW6 304 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF150Q9ULK6 438 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 ETV7Q9Y603 341 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR5H14A6NHG9 310 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 H0YJW9 148 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 BET1O15155 118 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 NBR2O15453 112 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 AIREO43918 545 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCGNO76038 276 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 SOX6P35712 828 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 TALDO1P37837 337 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 DEFA6Q01524 100 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 HACD4Q5VWC8 232 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 PHF21AQ96BD5 680 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM235A6NFC5 223 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 DTYMKP23919 212 aa15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms