RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293889.10

CCDC78-201, Transcript of coiled-coil domain containing 78, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC78, Length 1,611 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78-201ENST00000293889 UBA52P62987 128 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 PAX2Q02962 417 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 DHRS2Q13268 280 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 IGSF11Q5DX21 431 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 LYG2Q86SG7 212 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 KCNRGQ8N5I3 272 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 OR4A4PQ8NGN8 299 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 KIRREL1Q96J84 757 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 ZNF714Q96N38 554 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 TMUB1Q9BVT8 246 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 MFFQ9GZY8 342 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 FXYD6Q9H0Q3 95 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 SLC25A32Q9H2D1 315 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 LPAR2Q9HBW0 351 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 TAS2R3Q9NYW6 316 aa14.63□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 ABCA2Q9BZC7 2435 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 KRBOX1C9JBD0 128 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 BET1O15155 118 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 SPINT2O43291 252 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 OR2F2O95006 317 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 FGF2P09038 288 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 ZNF728P0DKX0 622 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 TAS2R46P59540 309 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 OR2F1Q13607 317 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 HERPUD1Q15011 391 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 OR5H2Q8NGV7 314 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 MITD1Q8WV92 249 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 IL1F10Q8WWZ1 152 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 LINC00574Q9H8X3 128 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 VSIG4Q9Y279 399 aa14.62□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 LIPFP07098 398 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 OMGP23515 440 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 CD34P28906 385 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 ERVFRD-1P60508 538 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 ACTBL2Q562R1 376 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 MRGPRFQ96AM1 343 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 C1orf159Q96HA4 380 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 MMP26Q9NRE1 261 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 TNFSF18Q9UNG2 199 aa14.61□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 MMP23AO75900 390 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 C11orf88Q6PI97 169 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 GALMQ96C23 342 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 CABLES2Q9BTV7 478 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 NECAP2Q9NVZ3 263 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 EHFQ9NZC4 300 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 PFDN2Q9UHV9 154 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 SESN1Q9Y6P5 492 aa14.6□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 A0A1W2PPH5 198 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 OR5H14A6NHG9 310 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 F2RL2O00254 374 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 ENSAO43768 121 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 CD99P14209 185 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 LTC4SQ16873 150 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 VAX1Q5SQQ9 334 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 LIN54Q6MZP7 749 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 PDZD9Q8IXQ8 264 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 C11orf42Q8N5U0 333 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 PHYHIPLQ96FC7 376 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 OR1A1Q9P1Q5 309 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 ONECUT1Q9UBC0 465 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 C9orf170A2RU37 121 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 C17orf98A8MV24 154 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 CTXN2P0C2S0 81 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 OR5H8P0DN80 308 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 HTD2P86397 168 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 C11orf87Q6NUJ2 197 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 HEPN1Q6WQI6 88 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 ZNF546Q86UE3 836 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 OR52L2PQ8NGH6 319 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 OR1S1Q8NH92 325 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 C18orf12Q96KH6 178 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 CXorf58Q96LI9 332 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 RAB9BQ9NP90 201 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa14.59□□□□□ -0.07
CCDC78-201ENST00000293889 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC78-201ENST00000293889 A0A0B4J2A0 478 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC78-201ENST00000293889 DBX1A6NMT0 343 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC78-201ENST00000293889 MSMBP08118 114 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC78-201ENST00000293889 IGHV3-43DP0DP04 118 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC78-201ENST00000293889 FPR2P25090 351 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC78-201ENST00000293889 LOXL3P58215 753 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC78-201ENST00000293889 TAS2R31P59538 309 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC78-201ENST00000293889 ARF6P62330 175 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC78-201ENST00000293889 GNMTQ14749 295 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC78-201ENST00000293889 TMED4Q7Z7H5 227 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms