RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000248948.3

VPREB3-201, Transcript of V-set pre-B cell surrogate light chain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VPREB3, Length 610 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3-201ENST00000248948 NDUFA11Q86Y39 141 aa10.14□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 S1PR3Q99500 378 aa10.14□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 NABP2Q9BQ15 211 aa10.14□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 AGMATQ9BSE5 352 aa10.14□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 TOLLIPQ9H0E2 274 aa10.14□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 RNF167Q9H6Y7 350 aa10.14□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa10.13□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 A0A075B6Q4 140 aa10.13□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa10.13□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 OR5H14A6NHG9 310 aa10.13□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 KCNAB3O43448 404 aa10.13□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 IGHG2P01859 326 aa10.13□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 TALDO1P37837 337 aa10.13□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 PITPNAQ00169 270 aa10.13□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 HNF4GQ14541 408 aa10.13□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 HACD4Q5VWC8 232 aa10.13□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 FOXRED2Q8IWF2 684 aa10.13□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa10.13□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 Q8N9W7 124 aa10.13□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 OR4X2Q8NGF9 303 aa10.13□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 ZNF251Q9BRH9 671 aa10.13□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 ABCG5Q9H222 651 aa10.13□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa10.12□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 OPN1MWP04001 364 aa10.12□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 CLEC2LP0C7M8 214 aa10.12□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 OPN1MW2P0DN77 364 aa10.12□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 OPN1MW3P0DN78 364 aa10.12□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 CD28P10747 220 aa10.12□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 CEACAM6P40199 344 aa10.12□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 OR3A3P47888 321 aa10.12□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa10.12□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 C9orf152Q5JTZ5 239 aa10.12□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 IDNKQ5T6J7 187 aa10.12□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 SLC35E3Q7Z769 313 aa10.12□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 C11orf44Q8N8P7 122 aa10.12□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 OR5AU1Q8NGC0 362 aa10.12□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 OR13F1Q8NGS4 319 aa10.12□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 CHPT1Q8WUD6 406 aa10.12□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 PHF21AQ96BD5 680 aa10.12□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 SLC25A38Q96DW6 304 aa10.12□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 DCSTAMPQ9H295 470 aa10.12□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 RDH8Q9NYR8 311 aa10.12□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 ZNF580Q9UK33 172 aa10.12□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 SPATA2Q9UM82 520 aa10.12□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 PSMB11A5LHX3 300 aa10.11□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 AP4M1O00189 453 aa10.11□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 SMIM18P0DKX4 95 aa10.11□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 GPR12P47775 334 aa10.11□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 CD83Q01151 205 aa10.11□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 MMDQ15546 238 aa10.11□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 ZNF260Q3ZCT1 412 aa10.11□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 OR10J5Q8NHC4 309 aa10.11□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 ABHD14BQ96IU4 210 aa10.11□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 RASL11BQ9BPW5 248 aa10.11□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 FUNDC2Q9BWH2 189 aa10.11□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 PLSCR3Q9NRY6 295 aa10.11□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 TMEM235A6NFC5 223 aa10.1□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa10.1□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 NBR2O15453 112 aa10.1□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 RBBP9O75884 186 aa10.1□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 MC5RP33032 325 aa10.1□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 GNG2P59768 71 aa10.1□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 ACTBP60709 375 aa10.1□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 SLC35B1P78383 322 aa10.1□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 CDNFQ49AH0 187 aa10.1□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 RPL39P5Q59GN2 51 aa10.1□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 IGSF11Q5DX21 431 aa10.1□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 FAM131AQ6UXB0 335 aa10.1□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 COMMD1Q8N668 190 aa10.1□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 OR4F17Q8NGA8 305 aa10.1□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 OR5AN1Q8NGI8 311 aa10.1□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 OR5H6Q8NGV6 325 aa10.1□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 OR4F4Q96R69 305 aa10.1□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 GON7Q9BXV9 100 aa10.1□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 ZNF221Q9UK13 617 aa10.1□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 WASHC3Q9Y3C0 194 aa10.1□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 PLXNB1O43157 2135 aa10.1□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 NOTCH1P46531 2555 aa10.1□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 H0YJW9 148 aa10.09□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 BET1O15155 118 aa10.09□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 NDUFA3O95167 84 aa10.09□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 HLA-DRB1P01911 266 aa10.09□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 CTXN2P0C2S0 81 aa10.09□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 GSTT2P0CG29 244 aa10.09□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 GSTT2BP0CG30 244 aa10.09□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 CT45A6P0DMU7 189 aa10.09□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 CT45A5P0DMU8 189 aa10.09□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 CT45A7P0DMV0 189 aa10.09□□□□□ -0.79
VPREB3-201ENST00000248948 SOX6P35712 828 aa10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.5 ms