RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001878.5

Hoxd12-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd12, Length 2,534 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Vmn1r233Q8R294 319 aa13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Olfr1301Q8VGE7 312 aa13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Atp5sQ9CRA7 200 aa13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Snu13Q9D0T1 128 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Sun5Q9DA32 373 aa13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 B3GNT2Q9Z222 397 aa13.17□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Olfr455A0A0B4J1M2 317 aa13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Ube2dnl2A2AFH2 155 aa13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Atxn7l3A2AWT3 347 aa13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Tmem92B7ZWI3 162 aa13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Phlda2O08969 144 aa13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Galr1P56479 348 aa13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Psg26Q4KL65 475 aa13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Hes3Q61657 175 aa13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Olfr1283Q7TQY4 305 aa13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 BivmQ8CBX9 502 aa13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Swsap1Q8VCI7 278 aa13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Olfr539Q8VGL9 319 aa13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Olfr974Q8VH09 310 aa13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Mtfp1Q9CRB8 166 aa13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 9230110F15RikQ9D262 117 aa13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Vmn1r41Q9EQ44 310 aa13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 P2ry4Q9JJS7 361 aa13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 TpbgQ9Z0L0 426 aa13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Eif2s3yQ9Z0N2 472 aa13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Trav15d-1-dv6d-1A0A075B624 124 aa13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Igkv13-84A0A140T8N3 115 aa13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Gm21970F6XX07 295 aa13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Phb2O35129 299 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Mrpl23O35972 146 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Ca6P18761 317 aa13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 SftpcP21841 193 aa13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Foxa3P35584 353 aa13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Gpr55Q3UJF0 327 aa13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 GalnsQ571E4 520 aa13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Rasl10bQ5SSG5 203 aa13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Nsun5Q8K4F6 465 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Snapc5Q8R2K7 98 aa13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Chrdl2Q8VEA6 426 aa13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Olfr493Q8VEW5 314 aa13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Egln1Q91YE3 400 aa13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 GmppaQ922H4 420 aa13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Mrpl41Q9CQN7 135 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Pga5Q9D106 387 aa13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Q9DAN9 164 aa13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Fbxw4Q9JMJ2 410 aa13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 EdarQ9R187 448 aa13.16□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Olfr896-ps1A0A1L1SRZ8 308 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Gm4787B2RUD9 748 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Arxes1C0HK79 180 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Arxes2C0HK80 180 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Olfr914E9PW59 316 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Olfr623E9Q382 317 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Gm3685J3QPP2 205 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Vmn2r66K7N6R9 851 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Olfr1564K7N6V7 318 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 TectbO08524 329 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Wipf3P0C7L0 485 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Tcl1b1P56840 116 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 BidP70444 195 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Vmn1r181Q0P547 304 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Esp1Q3LHH8 102 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 G6pc3Q6NSQ9 346 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Plekhm1Q7TSI1 1074 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Rnf144bQ8BKD6 301 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Olfr1459Q8VFV9 307 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Olfr483Q8VG05 315 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Tmem208Q9CR96 173 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Phf19Q9CXG9 578 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Hebp2Q9WU63 205 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Gm5493S4R2D1 92 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Ighv5-15A0A0A6YWC7 117 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Trbv15A0A0A6YYE3 115 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Igkv14-100A0A0G2JG36 117 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Zfp982A2A8Q4 368 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Gm17677B3GLJ5 116 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Gm21761J3QK00 171 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 LepP41160 167 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Vipr2P41588 437 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Defb4P82019 63 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Slc39a7Q31125 476 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Scarb1Q61009 509 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 PnkdQ69ZP3 385 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Pramel5Q7TPY4 500 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 SergefQ80YD6 464 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Scgb2b27Q8R1E9 112 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Vmn1r73Q8R293 303 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Loxl4Q924C6 757 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Cst6Q9D1B1 149 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Wbp2nlQ9D529 359 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Q9DAE7 121 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Gnpnat1Q9JK38 184 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Tbl1xQ9QXE7 527 aa13.15□□□□□ -0.3
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 CebpbP28033 296 aa13.14□□□□□ -0.31
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Mmp9P41245 730 aa13.14□□□□□ -0.31
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 G430049J08RikQ3TL09 166 aa13.14□□□□□ -0.31
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Prdm6Q3UZD5 596 aa13.14□□□□□ -0.31
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Trav5d-4Q5R1F6 114 aa13.14□□□□□ -0.31
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Vstm2lQ6PDS0 220 aa13.14□□□□□ -0.31
Hoxd12-201ENSMUST00000001878 Zfp874bQ7M6X2 447 aa13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 88.7 ms