RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638107.1

5S_rRNA.28-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 119 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MYOZ3Q8TDC0 251 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ASCL2Q99929 193 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SULT4A1Q9BR01 284 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FAAP24Q9BTP7 215 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ANKRD60Q9BZ19 345 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 IFI27L2Q9H2X8 130 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 OR51J1Q9H342 316 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KCNK15Q9H427 330 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RAB9BQ9NP90 201 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PARP11Q9NR21 331 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KCNIP1Q9NZI2 227 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZNF580Q9UK33 172 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FBXO7Q9Y3I1 522 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 U3KQK5 164 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 A0A0A6YYD4 124 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TRAV41A0A0B4J266 112 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 A0A1W2PN81 502 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 EBAG9O00559 213 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MYL12BO14950 172 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NBR2O15453 112 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ST8SIA5O15466 376 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 YPEL1O60688 119 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NDUFA3O95167 84 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HLA-DRB1P01911 266 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CD1AP06126 327 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 OR8U8P0C7N1 319 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 OR5H8P0DN80 308 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HTR2CP28335 458 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CHRNA7P36544 502 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HTD2P86397 168 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NDPQ00604 133 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZNF616Q08AN1 781 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HMGN3Q15651 99 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ACSM3Q53FZ2 586 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 LIN54Q6MZP7 749 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TMEM65Q6PI78 240 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FAM131AQ6UXB0 335 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 C6orf201Q7Z4U5 140 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZNF554Q86TJ5 538 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 LRRTM1Q86UE6 522 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NANOGP1Q8N7R0 232 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NKAIN3Q8N8D7 197 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NPBQ8NG41 125 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 OR1N2Q8NGR9 330 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SETD6Q8TBK2 473 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CASTOR1Q8WTX7 329 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 IL1F10Q8WWZ1 152 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DCUN1D4Q92564 292 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GALMQ96C23 342 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 UBE2E2Q96LR5 201 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 YPEL2Q96QA6 119 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZNF251Q9BRH9 671 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 UQCC2Q9BRT2 126 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NICN1Q9BSH3 213 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CST11Q9H112 138 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GHRLQ9UBU3 117 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 COL7A1Q02388 2944 aa4.59□□□□□ -1.68
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FCN1O00602 326 aa4.58□□□□□ -1.68
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 OVOL1O14753 267 aa4.58□□□□□ -1.68
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SOX15O60248 233 aa4.58□□□□□ -1.68
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RGS11O94810 467 aa4.58□□□□□ -1.68
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 LY86O95711 162 aa4.58□□□□□ -1.68
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 UBBP0CG47 229 aa4.58□□□□□ -1.68
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CT45A6P0DMU7 189 aa4.58□□□□□ -1.68
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CT45A5P0DMU8 189 aa4.58□□□□□ -1.68
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CT45A7P0DMV0 189 aa4.58□□□□□ -1.68
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RAB9AP51151 201 aa4.58□□□□□ -1.68
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SLURP1P55000 103 aa4.58□□□□□ -1.68
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RUNX1Q01196 453 aa4.58□□□□□ -1.68
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 UNC119Q13432 240 aa4.58□□□□□ -1.68
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RCN1Q15293 331 aa4.58□□□□□ -1.68
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ECSCRQ19T08 205 aa4.58□□□□□ -1.68
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 C5orf64Q2M2E5 130 aa4.58□□□□□ -1.68
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RPL39P5Q59GN2 51 aa4.58□□□□□ -1.68
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 C19orf54Q5BKX5 351 aa4.58□□□□□ -1.68
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 LY6G6FQ5SQ64 297 aa4.58□□□□□ -1.68
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SVOPQ8N4V2 548 aa4.58□□□□□ -1.68
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PACRGLQ8N7B6 248 aa4.58□□□□□ -1.68
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MINDY2Q8NBR6 621 aa4.58□□□□□ -1.68
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 OR2AK2Q8NG84 335 aa4.58□□□□□ -1.68
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FBLIM1Q8WUP2 373 aa4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms