RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628078.2

TCF4-262, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 1,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-262	ENST00000628078	FCN1	O00602	326 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	NBR2	O15453	112 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	SOX15	O60248	233 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	IGLV1-40	P01703	118 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	IGHV3-11	P01762	117 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	MYL12A	P19105	171 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	FUT3	P21217	361 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	10.45	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078		Q3ZCU0	254 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	OR10K2	Q6IF99	312 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	FBXL15	Q9H469	300 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		10.45	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	ST8SIA5	O15466	376 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	GPX5	O75715	221 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	CAPG	P40121	348 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	NDP	Q00604	133 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	DOC2B	Q14184	412 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	SETD6	Q8TBK2	473 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	CYGB	Q8WWM9	190 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	ARPC1A	Q92747	370 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM80	Q96HE8	168 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	RDH12	Q96NR8	316 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	RAB9B	Q9NP90	201 aa		10.44	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	TENM2	Q9NT68	2774 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	HLA-DRB1	P01911	266 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	GP9	P14770	177 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	INSL3	P51460	131 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	INSL4	Q14641	139 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	PLGLA	Q15195	96 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	STEAP3	Q658P3	488 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF429	Q86V71	674 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	GAPT	Q8N292	157 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	GGH	Q92820	318 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078		Q96M66	194 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	KCNK15	Q9H427	330 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	KIAA1456	Q9P272	454 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	GAB2	Q9UQC2	676 aa		10.43	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	LINC01619	G3V211	115 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	YPEL1	O60688	119 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	PDCD6	O75340	191 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	SC5D	O75845	299 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	CEL	P19835	753 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	LINC00205	P59089	165 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	CX3CL1	P78423	397 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	RUNX1	Q01196	453 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	ST3GAL4	Q11206	333 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	NPB	Q8NG41	125 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	GALM	Q96C23	342 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	DERL3	Q96Q80	235 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	YPEL2	Q96QA6	119 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	JPT1	Q9UK76	154 aa		10.42	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	IRGM	A1A4Y4	181 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078		H7C2Y5	167 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	CT45A6	P0DMU7	189 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	CT45A5	P0DMU8	189 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	CT45A7	P0DMV0	189 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	LYL1	P12980	280 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	FST	P19883	344 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	HTD2	P86397	168 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	LYPD6	Q86Y78	171 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		10.41	□□□□□ -0.74
TCF4-262	ENST00000628078	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		10.41	□□□□□ -0.74

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