RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARL16Q0P5N6 197 aa9.93□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GUSBP1Q15486 140 aa9.93□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 THNSL2Q86YJ6 484 aa9.93□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q8IYB0 196 aa9.93□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF610Q8N9Z0 462 aa9.93□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SFT2D1Q8WV19 159 aa9.93□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IL22RA2Q969J5 263 aa9.93□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TAAR6Q96RI8 345 aa9.93□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CEP295Q9C0D2 2601 aa9.93□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A1B0GU03 582 aa9.93□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGKV3-15P01624 115 aa9.93□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARG1P05089 322 aa9.93□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HOXC12P31275 282 aa9.93□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MDH2P40926 338 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AKR1D1P51857 326 aa9.93□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RFESDQ8TAC1 157 aa9.93□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RSG1Q9BU20 258 aa9.93□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KCNJ16Q9NPI9 418 aa9.93□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TREM2Q9NZC2 230 aa9.93□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C12orf77C9JDV5 145 aa9.92□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CBR1P16152 277 aa9.92□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPL35P42766 123 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MRGPRDQ8TDS7 321 aa9.92□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PLPPR2Q96GM1 343 aa9.92□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC35B3Q9H1N7 401 aa9.92□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SMCO4Q9NRQ5 59 aa9.92□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP9.92□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BSNQ9UPA5 3926 aa9.92□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 APC2O95996 2303 aa9.92□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MUC6Q6W4X9 2439 aa9.92□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa9.92□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa9.92□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGHV3-43DP0DP04 118 aa9.92□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RAB13P51153 203 aa9.92□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AVPI1Q5T686 147 aa9.92□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC25A24Q6NUK1 477 aa9.92□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 STX12Q86Y82 276 aa9.92□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 COMMD1Q8N668 190 aa9.92□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR8G5Q8NG78 346 aa9.92□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C5orf30Q96GV9 206 aa9.92□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ABHD14BQ96IU4 210 aa9.92□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ATP5SQ99766 215 aa9.92□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DCTN5Q9BTE1 182 aa9.92□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRAV17A0A0B4J275 112 aa9.91□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DEFB108AA8MXU0 73 aa9.91□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 J3QW42 95 aa9.91□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SYNGR2O43760 224 aa9.91□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRASP01116 189 aa9.91□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GABRA2P47869 451 aa9.91□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPL30P62888 115 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BAXQ07812 192 aa9.91□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HMGN3Q15651 99 aa9.91□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BTNL3Q6UXE8 466 aa9.91□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MOB1BQ7L9L4 216 aa9.91□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FGFRL1Q8N441 504 aa9.91□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 COQ2Q96H96 371 aa9.91□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PBDC1Q9BVG4 233 aa9.91□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR2D2Q9H210 308 aa9.91□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DKK4Q9UBT3 224 aa9.91□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WIPI2Q9Y4P8 454 aa9.91□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RBFOX3A6NFN3 312 aa9.91□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IL2RGP31785 369 aa9.91□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SSTR5P35346 364 aa9.91□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GLIPR1P48060 266 aa9.91□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SULT1A1P50225 295 aa9.91□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPANXN5Q5MJ07 72 aa9.91□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa9.91□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WDR82Q6UXN9 313 aa9.91□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 VSIRQ9H7M9 311 aa9.91□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A1W2PPH5 198 aa9.9□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HBZP02008 142 aa9.9□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LTC4SQ16873 150 aa9.9□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SOHLH1Q5JUK2 328 aa9.9□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRBOX4Q5JUW0 171 aa9.9□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM180AQ6UWF9 173 aa9.9□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HAPLN4Q86UW8 402 aa9.9□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GALMQ96C23 342 aa9.9□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HES4Q9HCC6 221 aa9.9□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PSENENQ9NZ42 101 aa9.9□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KCNIP1Q9NZI2 227 aa9.9□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A1W2PPE2 198 aa9.9□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AQP7O14520 342 aa9.9□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TNFSF13O75888 250 aa9.9□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MMP9P14780 707 aa9.9□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 COX5AP20674 150 aa9.9□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 G6PCP35575 357 aa9.9□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPS16P62249 146 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SHEQ5VZ18 495 aa9.9□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ACP7Q6ZNF0 438 aa9.9□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPRMLQ8N4K4 120 aa9.9□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HIST1H2BAQ96A08 127 aa9.9□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RAB40CQ96S21 281 aa9.9□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DUSP13Q9UII6 198 aa9.9□□□□□ -0.82
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PKDREJQ9NTG1 2253 aa9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms