RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561256.5

USP3-AS1-210, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 562 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-210ENST00000561256 C4orf3Q8WVX3 66 aa13.52□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 FCGR1BQ92637 280 aa13.52□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 FAM46BQ96A09 425 aa13.52□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 Q96M66 194 aa13.52□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 NEDD4LQ96PU5 975 aa13.52□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 ETAA1Q9NY74 926 aa13.52□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa13.52□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 STAB2Q8WWQ8 2551 aa13.51□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 SLC22A1O15245 554 aa13.51□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 BPNT1O95861 308 aa13.51□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 MT-ND4P03905 459 aa13.51□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 VDAC1P21796 283 aa13.51□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 FABP5Q01469 135 aa13.51□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 C6orf183Q5T699 404 aa13.51□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 TRAT1Q6PIZ9 186 aa13.51□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 TMEM91Q6ZNR0 172 aa13.51□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 Q8N6K4 173 aa13.51□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 CCDC107Q8WV48 283 aa13.51□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 ARL11Q969Q4 196 aa13.51□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 RCHY1Q96PM5 261 aa13.51□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 RASL11BQ9BPW5 248 aa13.51□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 TMEM59Q9BXS4 323 aa13.51□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF581Q9P0T4 197 aa13.51□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 TRAV39A0A0B4J263 110 aa13.5□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 PDCD5O14737 125 aa13.5□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 SPINT2O43291 252 aa13.5□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 ORC5O43913 435 aa13.5□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 ARSBP15848 533 aa13.5□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 FHL3Q13643 280 aa13.5□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 SPARTQ8N0X7 666 aa13.5□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 OR11H1Q8NG94 326 aa13.5□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 PALMDQ9NP74 551 aa13.5□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 KCNIP1Q9NZI2 227 aa13.5□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 PDCD6O75340 191 aa13.49□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 IGHG4P01861 327 aa13.49□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 GALP22466 123 aa13.49□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 MYL9P24844 172 aa13.49□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 INSL3P51460 131 aa13.49□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 RAB11BQ15907 218 aa13.49□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 TMEM30BQ3MIR4 351 aa13.49□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 SBSPONQ8IVN8 264 aa13.49□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 OR52M1Q8NGK5 317 aa13.49□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 S1PR3Q99500 378 aa13.49□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 NDUFB11Q9NX14 153 aa13.49□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 UBE2QL1A1L167 161 aa13.48□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 SLC17A2O00624 439 aa13.48□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 MOSP00540 346 aa13.48□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 CD37P11049 281 aa13.48□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 LYL1P12980 280 aa13.48□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 PSMB9P28065 219 aa13.48□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 CFHR3Q02985 330 aa13.48□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 UBE2UQ5VVX9 321 aa13.48□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 OR4K15Q8NH41 348 aa13.48□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 HSPB9Q9BQS6 159 aa13.48□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 V9GY05 133 aa13.48□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 TENM2Q9NT68 2774 aa13.47□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 RYR2Q92736 4967 aa13.47□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 OR8U8P0C7N1 319 aa13.47□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 OR5H8P0DN80 308 aa13.47□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 IL3RAP26951 378 aa13.47□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 PSMB8P28062 276 aa13.47□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 CD1BP29016 333 aa13.47□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 SOX6P35712 828 aa13.47□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 P2RY14Q15391 338 aa13.47□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 SSX1Q16384 188 aa13.47□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 OR10K2Q6IF99 312 aa13.47□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF773Q6PK81 442 aa13.47□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 OR8H1Q8NGG4 311 aa13.47□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 KCTD7Q96MP8 289 aa13.47□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 PLSCR3Q9NRY6 295 aa13.47□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa13.46□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa13.46□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 TMEM14DPA8MWL7 114 aa13.46□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 OVCH2Q7RTZ1 564 aa13.46□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF554Q86TJ5 538 aa13.46□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 PRR18Q8N4B5 295 aa13.46□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 LINC00311Q8N616 119 aa13.46□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 OR1N2Q8NGR9 330 aa13.46□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 TM2D1Q9BX74 207 aa13.46□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa13.46□□□□□ -0.25
USP3-AS1-210ENST00000561256 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.26
USP3-AS1-210ENST00000561256 LCE6AA0A183 80 aa13.45□□□□□ -0.26
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
USP3-AS1-210ENST00000561256 C15orf65H3BRN8 121 aa13.45□□□□□ -0.26
USP3-AS1-210ENST00000561256 IGF1P05019 195 aa13.45□□□□□ -0.26
USP3-AS1-210ENST00000561256 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF616Q08AN1 781 aa13.45□□□□□ -0.26
USP3-AS1-210ENST00000561256 Q3ZCU0 254 aa13.45□□□□□ -0.26
USP3-AS1-210ENST00000561256 SIGIRRQ6IA17 410 aa13.45□□□□□ -0.26
USP3-AS1-210ENST00000561256 TMEM65Q6PI78 240 aa13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.6 ms