RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513678.5

MATR3-222, Transcript of matrin 3, human

TSL 2

Gene MATR3, Length 444 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MATR3-222	ENST00000513678	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		13.25	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		13.25	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		13.25	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	ZFP57	Q9NU63	452 aa		13.25	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	ZNF580	Q9UK33	172 aa		13.25	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		13.25	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678		K7EIL1	84 aa		13.24	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	AP4M1	O00189	453 aa		13.24	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	HSMCR30	P0CW71	290 aa		13.24	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	ARSB	P15848	533 aa		13.24	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	GPR12	P47775	334 aa		13.24	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	THBS3	P49746	956 aa		13.24	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	SLC35B1	P78383	322 aa		13.24	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		13.24	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	LSAMP	Q13449	338 aa		13.24	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	GNMT	Q14749	295 aa		13.24	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	STPG2	Q8N412	459 aa		13.24	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		13.24	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		13.24	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	S1PR3	Q99500	378 aa		13.24	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	NICN1	Q9BSH3	213 aa		13.24	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	GON7	Q9BXV9	100 aa		13.24	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		13.24	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	HSF4	Q9ULV5	492 aa		13.24	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678		A0A0A6YYD4	124 aa		13.23	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	PSMD7	P51665	324 aa		13.23	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	KRTAP10-11	P60412	298 aa		13.23	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		13.23	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		13.23	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		13.23	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		13.23	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		13.23	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		13.23	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		13.23	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		13.23	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		13.23	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	RAB26	Q9ULW5	256 aa		13.23	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	LINC01548	A6NM66	108 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	ITGB1BP1	O14713	200 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	FABP5	Q01469	135 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	RNF152	Q8N8N0	203 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	P2RX4	Q99571	388 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	GHITM	Q9H3K2	345 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	KCNK15	Q9H427	330 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		13.22	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	LDLRAD4	O15165	306 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	SOCS1	O15524	211 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	MAP2K4	P45985	399 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	RAB11B	Q15907	218 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	CNBD2	Q96M20	576 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	NABP2	Q9BQ15	211 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		13.21	□□□□□ -0.29
MATR3-222	ENST00000513678	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MATR3-222	ENST00000513678	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
MATR3-222	ENST00000513678	IGF1	P05019	195 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MATR3-222	ENST00000513678	GAL	P22466	123 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MATR3-222	ENST00000513678	SOX6	P35712	828 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MATR3-222	ENST00000513678	MYCNOS	P40205	109 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MATR3-222	ENST00000513678	TMEM50B	P56557	158 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MATR3-222	ENST00000513678	GABARAPL2	P60520	117 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MATR3-222	ENST00000513678	CFHR3	Q02985	330 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MATR3-222	ENST00000513678	P2RY14	Q15391	338 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MATR3-222	ENST00000513678	SSX1	Q16384	188 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MATR3-222	ENST00000513678	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MATR3-222	ENST00000513678	TEX38	Q6PEX7	206 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MATR3-222	ENST00000513678	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MATR3-222	ENST00000513678	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MATR3-222	ENST00000513678	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MATR3-222	ENST00000513678	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MATR3-222	ENST00000513678	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MATR3-222	ENST00000513678	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MATR3-222	ENST00000513678		V9GY05	133 aa		13.2	□□□□□ -0.3
MATR3-222	ENST00000513678	TENM3	Q9P273	2699 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MATR3-222	ENST00000513678	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MATR3-222	ENST00000513678	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MATR3-222	ENST00000513678	ELANE	P08246	267 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MATR3-222	ENST00000513678	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
MATR3-222	ENST00000513678	F2RL1	P55085	397 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MATR3-222	ENST00000513678	FOXE3	Q13461	319 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MATR3-222	ENST00000513678	ZNF695	Q8IW36	515 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MATR3-222	ENST00000513678	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		13.19	□□□□□ -0.3
MATR3-222	ENST00000513678	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		13.19	□□□□□ -0.3

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