RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 ATP6V0E1O15342 81 aa13.17□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 YPEL1O60688 119 aa13.17□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 HLA-DRB1P01911 266 aa13.17□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 CD1AP06126 327 aa13.17□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 OR3A3P47888 321 aa13.17□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 WNT4P56705 351 aa13.17□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 HTD2P86397 168 aa13.17□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 LAIR2Q6ISS4 152 aa13.17□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa13.17□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 ZNF491Q8N8L2 437 aa13.17□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 OR1N2Q8NGR9 330 aa13.17□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 UBE2E2Q96LR5 201 aa13.17□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 YPEL2Q96QA6 119 aa13.17□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 OR5B12Q96R08 314 aa13.17□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 ANKRD60Q9BZ19 345 aa13.17□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 CST11Q9H112 138 aa13.17□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 PARP11Q9NR21 331 aa13.17□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
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HERC3-211ENST00000513325 INSL4Q14641 139 aa13.16□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 C6orf141Q5SZD1 244 aa13.16□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 ASPHD1Q5U4P2 390 aa13.16□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 OR10K2Q6IF99 312 aa13.16□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 LIN54Q6MZP7 749 aa13.16□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 AHSA2Q719I0 299 aa13.16□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 PACRGLQ8N7B6 248 aa13.16□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 GALMQ96C23 342 aa13.16□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 SULT4A1Q9BR01 284 aa13.16□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 C8orf4Q9NR00 106 aa13.16□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 GHRLQ9UBU3 117 aa13.16□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa13.16□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 VSIG4Q9Y279 399 aa13.16□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 TENM3Q9P273 2699 aa13.15□□□□□ -0.3
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HERC3-211ENST00000513325 OR8U8P0C7N1 319 aa13.15□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
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HERC3-211ENST00000513325 C5orf64Q2M2E5 130 aa13.15□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 LY6G6FQ5SQ64 297 aa13.15□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 NANOGP1Q8N7R0 232 aa13.15□□□□□ -0.3
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HERC3-211ENST00000513325 OR2AK2Q8NG84 335 aa13.15□□□□□ -0.3
HERC3-211ENST00000513325 THRSPQ92748 146 aa13.15□□□□□ -0.3
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HERC3-211ENST00000513325 ZNF616Q08AN1 781 aa13.14□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 FAM27D1Q5T7N8 215 aa13.14□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 C6orf201Q7Z4U5 140 aa13.14□□□□□ -0.31
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HERC3-211ENST00000513325 IL1F10Q8WWZ1 152 aa13.14□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 IFI27L2Q9H2X8 130 aa13.14□□□□□ -0.31
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HERC3-211ENST00000513325 LY86O95711 162 aa13.13□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 UBBP0CG47 229 aa13.13□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 INSL3P51460 131 aa13.13□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
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HERC3-211ENST00000513325 STEAP1Q9UHE8 339 aa13.13□□□□□ -0.31
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HERC3-211ENST00000513325 C1orf100Q5SVJ3 147 aa13.12□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 GLT8D1Q68CQ7 371 aa13.12□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 FAM131AQ6UXB0 335 aa13.12□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 SVOPQ8N4V2 548 aa13.12□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 FBLIM1Q8WUP2 373 aa13.12□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 DCUN1D4Q92564 292 aa13.12□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 NICN1Q9BSH3 213 aa13.12□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 TMEM59Q9BXS4 323 aa13.12□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 KCNK15Q9H427 330 aa13.12□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 FBXL15Q9H469 300 aa13.12□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 FKBP14Q9NWM8 211 aa13.12□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 PIPOXQ9P0Z9 390 aa13.12□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 FBXO7Q9Y3I1 522 aa13.12□□□□□ -0.31
HERC3-211ENST00000513325 A0A1W2PN81 502 aa13.11□□□□□ -0.31
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