RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496043.5

PTPRF-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRF, Length 415 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-214ENST00000496043 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
PTPRF-214ENST00000496043 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRF-214ENST00000496043 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
PTPRF-214ENST00000496043 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
PTPRF-214ENST00000496043 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
PTPRF-214ENST00000496043 ARL6IP5O75915 188 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 ELANEP08246 267 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 VDAC1P21796 283 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 MYF6P23409 242 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 RANBP1P43487 201 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 QRFPP83859 136 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 LSAMPQ13449 338 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 FOXE3Q13461 319 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 GNMTQ14749 295 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 HMGN3Q15651 99 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 DEFB121Q5J5C9 76 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 ETV3LQ6ZN32 361 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 C18orf65Q6ZTR6 163 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 DPF1Q92782 380 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 CYYR1Q96J86 154 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 ZNF251Q9BRH9 671 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 CCDC90BQ9GZT6 254 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 PLGRKTQ9HBL7 147 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 STEAP1Q9UHE8 339 aa10.02□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 IGF1P05019 195 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 ARSBP15848 533 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 UNC119Q13432 240 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 KIR2DS1Q14954 304 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 MMDQ15546 238 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 ZNF880Q6PDB4 577 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 TMEM91Q6ZNR0 172 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 ODF3L1Q8IXM7 274 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 OR2AK2Q8NG84 335 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 SETD6Q8TBK2 473 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 IL1F10Q8WWZ1 152 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 P2RX4Q99571 388 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 NABP2Q9BQ15 211 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 HSPB9Q9BQS6 159 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 NICN1Q9BSH3 213 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 VCX3BQ9H321 246 aa10.01□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 CCL24O00175 119 aa10□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 SLC17A2O00624 439 aa10□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 SOCS1O15524 211 aa10□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 NAPSAO96009 420 aa10□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 IGHG4P01861 327 aa10□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 OR5H8P0DN80 308 aa10□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 CPEP16870 476 aa10□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 CRHBPP24387 322 aa10□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 OR3A3P47888 321 aa10□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 PSMD7P51665 324 aa10□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 KRTAP10-11P60412 298 aa10□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 ACTBP60709 375 aa10□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 RPS25P62851 125 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 P2RY14Q15391 338 aa10□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 RAB11BQ15907 218 aa10□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa10□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 PRSS48Q7RTY5 328 aa10□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 FAM89BQ8N5H3 189 aa10□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 RNF152Q8N8N0 203 aa10□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 MGLLQ99685 303 aa10□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 ANKRD60Q9BZ19 345 aa10□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 LPAR5Q9H1C0 372 aa10□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 GHITMQ9H3K2 345 aa10□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 KCNK15Q9H427 330 aa10□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 PIPOXQ9P0Z9 390 aa10□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 ZNF580Q9UK33 172 aa10□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 HSF4Q9ULV5 492 aa10□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 MGAT4AQ9UM21 535 aa10□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 A0A0A6YYD4 124 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 K7EIL1 84 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 RAB29O14966 203 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 CEACAM6P40199 344 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 C2orf76Q3KRA6 126 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 LIN54Q6MZP7 749 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 LCNL1Q6ZST4 164 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 MOB1BQ7L9L4 216 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 SVOPQ8N4V2 548 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 OR8U1Q8NH10 309 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 RAX2Q96IS3 184 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 RITA1Q96K30 269 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 KCTD7Q96MP8 289 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 GFI1Q99684 422 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 ACOT13Q9NPJ3 140 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRF-214ENST00000496043 KIAA1456Q9P272 454 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms