RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492897.3

HOXB-AS3-214, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3

Gene HOXB-AS3, Length 309 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-214ENST00000492897 AWAT2Q6E213 333 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXB-AS3-214ENST00000492897 LRRTM1Q86UE6 522 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ODF3L1Q8IXM7 274 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NKAIN3Q8N8D7 197 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXB-AS3-214ENST00000492897 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
HOXB-AS3-214ENST00000492897 THRSPQ92748 146 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RAX2Q96IS3 184 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXB-AS3-214ENST00000492897 HSPB9Q9BQS6 159 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXB-AS3-214ENST00000492897 GPR61Q9BZJ8 451 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TAF9BQ9HBM6 251 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PALMDQ9NP74 551 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RAB9BQ9NP90 201 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXB-AS3-214ENST00000492897 GNG12Q9UBI6 72 aa11.71□□□□□ -0.53
HOXB-AS3-214ENST00000492897 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RYR3Q15413 4870 aa11.7□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa11.7□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 H3BMQ9 156 aa11.7□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 IGHG4P01861 327 aa11.7□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ELANEP08246 267 aa11.7□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CALRP27797 417 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 HTD2P86397 168 aa11.7□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 INSL4Q14641 139 aa11.7□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 KIR2DS1Q14954 304 aa11.7□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 C1orf100Q5SVJ3 147 aa11.7□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 AHSA2Q719I0 299 aa11.7□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 C5orf24Q7Z6I8 188 aa11.7□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CROCCP3Q8IVE0 287 aa11.7□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 OR10V1Q8NGI7 309 aa11.7□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 MYOZ3Q8TDC0 251 aa11.7□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 VSIG8P0DPA2 414 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CHATP28329 748 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 QRFPP83859 136 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 GNMTQ14749 295 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PHYHIPQ92561 330 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RITA1Q96K30 269 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 GON7Q9BXV9 100 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 OR2S2Q9NQN1 319 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 JPT1Q9UK76 154 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 UBE2QL1A1L167 161 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CCL24O00175 119 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 MYL12BO14950 172 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 YPEL1O60688 119 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CDK1P06493 297 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 UBBP0CG47 229 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PSMB8P28062 276 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PPIFP30405 207 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 GPR50Q13585 617 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NEDD8Q15843 81 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ACSM3Q53FZ2 586 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 FAM27D1Q5T7N8 215 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ZNF880Q6PDB4 577 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 LCNL1Q6ZST4 164 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 MS4A15Q8N5U1 240 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 OR52L2PQ8NGH6 319 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 YPEL2Q96QA6 119 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 RASL11BQ9BPW5 248 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SULT4A1Q9BR01 284 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TM2D1Q9BX74 207 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ERGIC3Q9Y282 383 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 A3GALT2U3KPV4 340 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NAPSAO96009 420 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 SOX6P35712 828 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 UNC119Q13432 240 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 FHL3Q13643 280 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 IRF3Q14653 427 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 HMGN3Q15651 99 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 PRR18Q8N4B5 295 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 FAM46BQ96A09 425 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 DUX3Q96PT4 197 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NABP2Q9BQ15 211 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CST11Q9H112 138 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ACOT13Q9NPJ3 140 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 TMEM14DPA8MWL7 114 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NUDT19A8MXV4 375 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 UCHL1P09936 223 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 HTR2CP28335 458 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 VAX1Q5SQQ9 334 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 OR10K2Q6IF99 312 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 ZNF367Q7RTV3 350 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 NPBQ8NG41 125 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 OR8U1Q8NH10 309 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 KCTD7Q96MP8 289 aa11.66□□□□□ -0.54
HOXB-AS3-214ENST00000492897 B9D2Q9BPU9 175 aa11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.8 ms