RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 KIR2DS4P43632 304 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 CBX5P45973 191 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 UBE2E1P51965 193 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 HTD2P86397 168 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 KIR2DS1Q14954 304 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 HERPUD1Q15011 391 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 PYDC2Q56P42 97 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 NCR3LG1Q68D85 454 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 PYHIN1Q6K0P9 492 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 Q6ZS49 121 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF554Q86TJ5 538 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 BEST4Q8NFU0 473 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 OR4A4PQ8NGN8 299 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 C15orf40Q8WUR7 153 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 FCAMRQ8WWV6 532 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 C22orf15Q8WYQ4 148 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 CLEC7AQ9BXN2 247 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 SCPEP1Q9HB40 452 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 RAB9BQ9NP90 201 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 OR2S2Q9NQN1 319 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 PTTG2Q9NZH5 202 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 GNG12Q9UBI6 72 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF69Q9UC07 566 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 NUP50Q9UKX7 468 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 PSG11Q9UQ72 335 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 V9GYH0 126 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 VPS13CQ709C8 3753 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A087X0M5 115 aa6.83□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A1B0GX30 115 aa6.83□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 GABARAPH6UMI1 98 aa6.83□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 J3QR06 171 aa6.83□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 TOR1AO14656 332 aa6.83□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 NPFFO15130 113 aa6.83□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 CTDSPLO15194 276 aa6.83□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 SHOXO15266 292 aa6.83□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 HSPA12AO43301 675 aa6.83□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 TPPPO94811 219 aa6.83□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 PMP2P02689 132 aa6.83□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 HLA-DMAP28067 261 aa6.83□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 CD34P28906 385 aa6.83□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 CEACAM6P40199 344 aa6.83□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF134P52741 427 aa6.83□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 PRRX1P54821 245 aa6.83□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 ARPC4P59998 168 aa6.83□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 CHRFAM7AQ494W8 412 aa6.83□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 MORN2Q502X0 79 aa6.83□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 SPANXN2Q5MJ10 180 aa6.83□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa6.83□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.83□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 OR11H6Q8NGC7 330 aa6.83□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 OR52M1Q8NGK5 317 aa6.83□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 C17orf50Q8WW18 174 aa6.83□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 SNAPC3Q92966 411 aa6.83□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 CABLES2Q9BTV7 478 aa6.83□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 KLK11Q9UBX7 282 aa6.83□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 ANXA10Q9UJ72 324 aa6.83□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 JPT1Q9UK76 154 aa6.83□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.83□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 ANAPC10Q9UM13 185 aa6.83□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 RABL2BQ9UNT1 228 aa6.83□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa6.82□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A0U1RQK1 487 aa6.82□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa6.82□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 ODF3BA8MYP8 253 aa6.82□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 J3QRK9 145 aa6.82□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 LANCL1O43813 399 aa6.82□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 YPEL1O60688 119 aa6.82□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 CRLF1O75462 422 aa6.82□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 RBBP9O75884 186 aa6.82□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 RGS11O94810 467 aa6.82□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 SRD5A1P18405 259 aa6.82□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 NAT1P18440 290 aa6.82□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 ZBTB25P24278 435 aa6.82□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 PAX6P26367 422 aa6.82□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 RCVRNP35243 200 aa6.82□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 SAA4P35542 130 aa6.82□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 ETV6P41212 452 aa6.82□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 LGALS4P56470 323 aa6.82□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF79Q15937 498 aa6.82□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 HLA-DRB5Q30154 266 aa6.82□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM30BQ3MIR4 351 aa6.82□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 CT45A1Q5HYN5 189 aa6.82□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa6.82□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 STEAP3Q658P3 488 aa6.82□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF626Q68DY1 528 aa6.82□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 TEX29Q8N6K0 151 aa6.82□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF439Q8NDP4 499 aa6.82□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 OR5AP2Q8NGF4 316 aa6.82□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 OR9G1Q8NH87 305 aa6.82□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 OR10J5Q8NHC4 309 aa6.82□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 CT45A3Q8NHU0 189 aa6.82□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 SMIM4Q8WVI0 70 aa6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms