RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462421.1

DDX39B-216, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 618 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-216ENST00000462421 HSF4Q9ULV5 492 aa7.17□□□□□ -1.26
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DDX39B-216ENST00000462421 OR4A4PQ8NGN8 299 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 PTX4Q96A99 478 aa7.14□□□□□ -1.27
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DDX39B-216ENST00000462421 RNF150Q9ULK6 438 aa7.14□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa7.13□□□□□ -1.27
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DDX39B-216ENST00000462421 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 CD36P16671 472 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 ZNF137PP52743 207 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 GP2P55259 537 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 RAB25P57735 213 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 ARPC4P59998 168 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 MXD1Q05195 221 aa7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
DDX39B-216ENST00000462421 LSAMPQ13449 338 aa7.13□□□□□ -1.27
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