RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 AKIP1Q9NQ31 210 aa9.35□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 DIABLOQ9NR28 239 aa9.35□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 CALYQ9NYX4 217 aa9.35□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 UBE2QL1A1L167 161 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 FABP12A6NFH5 140 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 MCRIP1C9JLW8 97 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 SOCS1O15524 211 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 SSTR5P35346 364 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 GNG10P50151 68 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 RAB13P51153 203 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 TAS2R20P59543 309 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 C17orf58Q2M2W7 97 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 MINOS1Q5TGZ0 78 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 TMEM219Q86XT9 240 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 MFSD4AQ8N468 514 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 OR56B1Q8NGI3 324 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 CORO2AQ92828 525 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 LEAP2Q969E1 77 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 B9D2Q9BPU9 175 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 ZNF286AQ9HBT8 521 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 ETAA1Q9NY74 926 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 V9GYH0 126 aa9.34□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 TRAV18A0A075B6X5 111 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 A0A1W2PRX2 142 aa9.33□□□□□ -0.92
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PRAME-210ENST00000442481 SCGNO76038 276 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 HTR1DP28221 377 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 ETV6P41212 452 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 ZNF846Q147U1 533 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 RTN4RL2Q86UN3 420 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 SNX29P2Q8IUI4 249 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 PRR18Q8N4B5 295 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 OR4P4Q8NGL7 312 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 OR10R2Q8NGX6 335 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 OR4K15Q8NH41 348 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 ZNF596Q8TC21 504 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 KIRREL1Q96J84 757 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 NEDD4LQ96PU5 975 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 IFT22Q9H7X7 185 aa9.33□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 A0A0A6YYH2 397 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 A6NJ64 397 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 XRCC3O43542 346 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 PTHLHP12272 177 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 BRS3P32247 399 aa9.32□□□□□ -0.92
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PRAME-210ENST00000442481 UTF1Q5T230 341 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 PYHIN1Q6K0P9 492 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 FAM89BQ8N5H3 189 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 ARL11Q969Q4 196 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 RAB3CQ96E17 227 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 CYYR1Q96J86 154 aa9.32□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 A0A1W2PPE3 182 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 FAM90A10PA6NDY2 464 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 FAM90A18PA6NE21 464 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 FAM90A16PA6NEW6 464 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 TMEM235A6NFC5 223 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 FAM90A7PA6NKC0 464 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 FAM90A22PA8MWA6 464 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 FAM90A12PA8MX19 464 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 LEUTXA8MZ59 168 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 J3QRK9 145 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 M0QZK8 103 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 PDCD6O75340 191 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 FAM90A15PP0C7V4 464 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 FAM90A13PP0C7W8 464 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 FAM90A14PP0C7W9 464 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 FAM90A24PP0C7X0 464 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 IGHV3-43DP0DP04 118 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 GNB3P16520 340 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 FUT3P21217 361 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 CHATP28329 748 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 SLC6A1P30531 599 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 CEACAM3P40198 252 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 MNDAP41218 407 aa9.31□□□□□ -0.92
PRAME-210ENST00000442481 BLCAPP62952 87 aa9.31□□□□□ -0.92
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