RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TNFRSF19Q9NS68 423 aa12.33□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TCF19Q9Y242 345 aa12.33□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 JMJD1CQ15652 2540 aa12.33□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRAV18A0A075B6X5 111 aa12.32□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A1B0GUS0 222 aa12.32□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FABP7O15540 132 aa12.32□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 XRCC3O43542 346 aa12.32□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NDUFA7O95182 113 aa12.32□□□□□ -0.44
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 CT45A1Q5HYN5 189 aa12.32□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR2AK2Q8NG84 335 aa12.32□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR52L2PQ8NGH6 319 aa12.32□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CT45A3Q8NHU0 189 aa12.32□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EDARADDQ8WWZ3 215 aa12.32□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CABLES2Q9BTV7 478 aa12.32□□□□□ -0.44
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM106CPP0CH98 169 aa12.31□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF134P52741 427 aa12.31□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GNMTQ14749 295 aa12.31□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLA1AQ53H76 456 aa12.31□□□□□ -0.44
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 C16orf82Q7Z2V1 217 aa12.31□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 THNSL2Q86YJ6 484 aa12.31□□□□□ -0.44
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa12.31□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AUNIPQ9H7T9 357 aa12.31□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COMMD3Q9UBI1 195 aa12.31□□□□□ -0.44
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A1W2PPE3 182 aa12.3□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A1W2PPI3 338 aa12.3□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LANCL1O43813 399 aa12.3□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CTXN2P0C2S0 81 aa12.3□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PAX6P26367 422 aa12.3□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CBX5P45973 191 aa12.3□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM69Q5SWH9 247 aa12.3□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM71F2Q6NXP2 309 aa12.3□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ISOC1Q96CN7 298 aa12.3□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AKR1E2Q96JD6 320 aa12.3□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C1RLQ9NZP8 487 aa12.3□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PIPOXQ9P0Z9 390 aa12.3□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC23A1Q9UHI7 598 aa12.3□□□□□ -0.44
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa12.29□□□□□ -0.44
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TIMM23O14925 209 aa12.29□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC31A2O15432 143 aa12.29□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TSPAN9O75954 239 aa12.29□□□□□ -0.44
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 CEACAM6P40199 344 aa12.29□□□□□ -0.44
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 LY6EQ16553 131 aa12.29□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa12.29□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LYG1Q8N1E2 194 aa12.29□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR10J5Q8NHC4 309 aa12.29□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa12.29□□□□□ -0.44
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa12.29□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IFI27L2Q9H2X8 130 aa12.29□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa12.28□□□□□ -0.44
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RAB29O14966 203 aa12.28□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SSX5O60225 188 aa12.28□□□□□ -0.44
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 GSTT2BP0CG30 244 aa12.28□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RAB13P51153 203 aa12.28□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RAG2P55895 527 aa12.28□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TAS2R20P59543 309 aa12.28□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HERPUD1Q15011 391 aa12.28□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C5orf24Q7Z6I8 188 aa12.28□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IZUMO1Q8IYV9 350 aa12.28□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CFHR4Q92496 578 aa12.28□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa12.28□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C16orf95Q9H693 158 aa12.28□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BEX1Q9HBH7 125 aa12.28□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR1A1Q9P1Q5 309 aa12.28□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CEPT1Q9Y6K0 416 aa12.28□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WNK2Q9Y3S1 2297 aa12.28□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DNHD1Q96M86 4753 aa12.28□□□□□ -0.44
PGGT1BP2-201ENST00000398621 M0QZK8 103 aa12.27□□□□□ -0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CD1BP29016 333 aa12.27□□□□□ -0.45
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