RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227667.7

APOC3-201, Transcript of apolipoprotein C3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOC3, Length 550 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3-201ENST00000227667 MICBQ29980 383 aa8.76□□□□□ -1.01
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APOC3-201ENST00000227667 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa8.73□□□□□ -1.01
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