RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 SERPINA7P05543 415 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 FBLN7Q53RD9 439 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 KLHL24Q6TFL4 600 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 KLHDC7BQ96G42 594 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 NAT8Q9UHE5 227 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 TCFL5Q9UL49 500 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 POLR1DQ9Y2S0 133 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 LRBAP50851 2863 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 ODAMA1E959 279 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 F6UZH7 168 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 CHST1O43916 411 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 PITX3O75364 302 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 PSG1P11464 419 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 FBXW4P57775 412 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 EMC4Q5J8M3 183 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 SPIN3Q5JUX0 258 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM108Q6UXF1 575 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 TEX43Q6ZNM6 134 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 SLAMF6Q96DU3 332 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 CTDSP1Q9GZU7 261 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 WWTR1Q9GZV5 400 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 NPIPA2E9PIF3 369 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 PGCP20142 388 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 EFNA3P52797 238 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 MUC6Q6W4X9 2439 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 OR4F5Q8NH21 305 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 OR4F4Q96R69 305 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 RNF2Q99496 336 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 PYGO2Q9BRQ0 406 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 FBXL7Q9UJT9 491 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 ANAPC10Q9UM13 185 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 R4GN57 208 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 TRDCB7Z8K6 153 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 H3BML4 177 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 K7EP13 123 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 YPEL1O60688 119 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF737O75373 536 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 IGHV4-34P06331 123 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 CBLN1P23435 193 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 CDAP32320 146 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 EXT1Q16394 746 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 OR5L2Q8NGL0 311 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 PSMF1Q92530 271 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 MOB3AQ96BX8 217 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 YPEL2Q96QA6 119 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 PARLQ9H300 379 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 FAM206AQ9NX38 181 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 VDAC3Q9Y277 283 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 CLDN16Q9Y5I7 305 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 FREM1Q5H8C1 2179 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 NPIPA5E9PKD4 350 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 CBR3O75828 277 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 GYPAP02724 150 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 BLKP51451 505 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 LINC00310P59036 64 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 RPS16P62249 146 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 RPL19P84098 196 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 BAGE3Q86Y29 109 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 BAGE2Q86Y30 109 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF738Q8NE65 137 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 OR2M3Q8NG83 312 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 OR4D5Q8NGN0 318 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF596Q8TC21 504 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 C18orf12Q96KH6 178 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 SLC46A1Q96NT5 459 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 SLC25A22Q9H936 323 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF286AQ9HBT8 521 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 WNT16Q9UBV4 365 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 COPS7AQ9UBW8 275 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 ANXA10Q9UJ72 324 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 NPIPA1Q9UND3 350 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 HSPB2A8KAH6 182 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 DIRC3C9JPN6 131 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 HYPMO75409 117 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 VAMP5O95183 116 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 CRYAAP02489 173 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 ISG15P05161 165 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 CELA2AP08217 269 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 IAPPP10997 89 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 FCGR2AP12318 317 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 PMCHP20382 165 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRT-211ENST00000618610 TAS2R30P59541 319 aa7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms