RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578995.5

SMARCE1-215, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 2

Gene SMARCE1, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-215ENST00000578995 METTL11BQ5VVY1 283 aa3.06□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 ZNF626Q68DY1 528 aa3.06□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 BRD3OSQ6XYD6 125 aa3.06□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 USP43Q70EL4 1123 aa3.06□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 GDPD3Q7L5L3 318 aa3.06□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 ZNF554Q86TJ5 538 aa3.06□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 CROCCP3Q8IVE0 287 aa3.06□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 ODF3L1Q8IXM7 274 aa3.06□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 FAM185AQ8N0U4 392 aa3.06□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 C8orf31Q8N9H6 132 aa3.06□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 OR56B1Q8NGI3 324 aa3.06□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 OR4P4Q8NGL7 312 aa3.06□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 OR4K15Q8NH41 348 aa3.06□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 OR1L1Q8NH94 360 aa3.06□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 UBALD1Q8TB05 177 aa3.06□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 PIFOQ8TCI5 191 aa3.06□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 MRGPRDQ8TDS7 321 aa3.06□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
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SMARCE1-215ENST00000578995 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa3.06□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 FAHD2AQ96GK7 314 aa3.06□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 C5orf30Q96GV9 206 aa3.06□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 CMTM3Q96MX0 182 aa3.06□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 ZNF714Q96N38 554 aa3.06□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 ZNF251Q9BRH9 671 aa3.06□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 CABLES2Q9BTV7 478 aa3.06□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa3.06□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 AUNIPQ9H7T9 357 aa3.06□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 SPACA1Q9HBV2 294 aa3.06□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 Q9N2K0 584 aa3.06□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 ESM1Q9NQ30 184 aa3.06□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 SIRT7Q9NRC8 400 aa3.06□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 CALYQ9NYX4 217 aa3.06□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 LPAR3Q9UBY5 353 aa3.06□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 PEX16Q9Y5Y5 336 aa3.06□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 AUP1Q9Y679 476 aa3.06□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 V9GYH0 126 aa3.06□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 ANK2Q01484 3957 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa3.05□□□□□ -1.92
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SMARCE1-215ENST00000578995 A0A0A6YYH2 397 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 A0A0U1RQK1 487 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 A0A1W2PQ09 198 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 MEIOCA2RUB1 952 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 TMEM235A6NFC5 223 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 A6NJ64 397 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 SERPINE3A8MV23 424 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 MCRIP1C9JLW8 97 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 NPFFO15130 113 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 XRCC3O43542 346 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 HPGDSO60760 199 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 VENTXO95231 258 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 IGLV2-14P01704 120 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 HBZP02008 142 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 APOA1P02647 267 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 SCTP09683 121 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 GNB3P16520 340 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 NAT1P18440 290 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 OMGP23515 440 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 FPR2P25090 351 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 PAX6P26367 422 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 KRTAP5-9P26371 169 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 SAA4P35542 130 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 GLP1RP43220 463 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 RORCP51449 518 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 UBE2E1P51965 193 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 ZNF134P52741 427 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 TAS2R20P59543 309 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 HLA-DRB3P79483 266 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 ZNF79Q15937 498 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa3.05□□□□□ -1.92
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SMARCE1-215ENST00000578995 CT45A1Q5HYN5 189 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 ATAD3CQ5T2N8 411 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 HACD4Q5VWC8 232 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 BTNL3Q6UXE8 466 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 Q6ZTK2 550 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 LAX1Q8IWV1 398 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 IZUMO1Q8IYV9 350 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 LINC00311Q8N616 119 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 SAMD12Q8N8I0 201 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 ZDHHC22Q8N966 263 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 BEND2Q8NDZ0 799 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 OR10A7Q8NGE5 316 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 OR52M1Q8NGK5 317 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 CT45A3Q8NHU0 189 aa3.05□□□□□ -1.92
SMARCE1-215ENST00000578995 PPP1R35Q8TAP8 253 aa3.05□□□□□ -1.92
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