RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552931.1

SMARCC2-215, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin subfamily c member 2, human

TSL 3

Gene SMARCC2, Length 608 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMARCC2-215	ENST00000552931	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	FAM189A2	Q15884	450 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	XAF1	Q6GPH4	301 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	OSR2	Q8N2R0	312 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	TMEM104	Q8NE00	496 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	TFAP2C	Q92754	450 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	AMBN	Q9NP70	447 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	ZFP57	Q9NU63	452 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	CALY	Q9NYX4	217 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	PSG11	Q9UQ72	335 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	SIRPB1	O00241	398 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	TOR1A	O14656	332 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	DIRAS3	O95661	229 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	UBB	P0CG47	229 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	LYL1	P12980	280 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	GDNF	P39905	211 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	CAPG	P40121	348 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	VHL	P40337	213 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	GLP1R	P43220	463 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	PCP4	P48539	62 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	RAB13	P51153	203 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	WNT4	P56705	351 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	PPP3R1	P63098	170 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	ST3GAL4	Q11206	333 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	EDDM3A	Q14507	147 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	RSU1	Q15404	277 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	LY6E	Q16553	131 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	NDNF	Q8TB73	568 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	CYGB	Q8WWM9	190 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	DERL3	Q96Q80	235 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	SPACA5	Q96QH8	159 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	OR14A2	Q96R54	314 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	CKLF	Q9UBR5	152 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	KIF25	Q9UIL4	384 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	PIN1P1	O15428	100 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	LANCL1	O43813	399 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	PAGE4	O60829	102 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	IGF1	P05019	195 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	CD28	P10747	220 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	FUT3	P21217	361 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	CAMLG	P49069	296 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	ZNF134	P52741	427 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	SLC35A2	P78381	396 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	IGSF11	Q5DX21	431 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	C6orf183	Q5T699	404 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	DDI2	Q5TDH0	399 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SMARCC2-215	ENST00000552931	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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