RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 GABARAPL2P60520 117 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 HIST1H2BAQ96A08 127 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 POTEKPQ9BYX7 375 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 UBQLN4Q9NRR5 601 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 PSMD13Q9UNM6 376 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 PREX1Q8TCU6 1659 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 MYO5BQ9ULV0 1848 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 TEX14Q8IWB6 1497 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 F5H5T6 163 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 H3BSA7 217 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 DENRO43583 198 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 AGTR1P30556 359 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 TAF9Q16594 264 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 FUNDC1Q8IVP5 155 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 OR11G2Q8NGC1 345 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 PKMYT1Q99640 499 aa3.88□□□□□ -1.79
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PTPRC-212ENST00000491302 OPN1SWP03999 348 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 CFL1P23528 166 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 DNAL1Q4LDG9 190 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 C10orf91Q5T1B1 145 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM208Q9BTX3 173 aa3.87□□□□□ -1.79
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PTPRC-212ENST00000491302 GLS2Q9UI32 602 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 CLUHO75153 1309 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 ADCY10Q96PN6 1610 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 KIAA0556O60303 1618 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1B0GU33 70 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 CBR3O75828 277 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 P0C880 135 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 COL8A2P25067 703 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 SULT1A2P50226 295 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 C1DQ13901 141 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
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PTPRC-212ENST00000491302 SCGB1D4Q6XE38 83 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
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PTPRC-212ENST00000491302 SLC23A2Q9UGH3 650 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 C15orf41Q9Y2V0 281 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00588Q9Y4M8 146 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 CEP350Q5VT06 3117 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa3.85□□□□□ -1.79
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PTPRC-212ENST00000491302 GABRA3P34903 492 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 APOFQ13790 326 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 MAPK14Q16539 360 aa3.85□□□□□ -1.79
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PTPRC-212ENST00000491302 XKRXQ6PP77 449 aa3.85□□□□□ -1.79
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PTPRC-212ENST00000491302 CD302Q8IX05 232 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 HS3ST5Q8IZT8 346 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 Q8NAQ8 132 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 LY6G5BQ8NDX9 201 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 ZNRF2Q8NHG8 242 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 OR5P3Q8WZ94 311 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 C11orf49Q9H6J7 331 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 GLI2P10070 1586 aa3.85□□□□□ -1.79
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PTPRC-212ENST00000491302 ZW10O43264 779 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 CD99P14209 185 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 ADORA1P30542 326 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 COTL1Q14019 142 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 DRAM2Q6UX65 266 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 PLCZ1Q86YW0 608 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 GTSF1LQ9H1H1 148 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00527Q9UJ94 153 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-212ENST00000491302 SDK2Q58EX2 2172 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-212ENST00000491302 A0A0A6YYH2 397 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-212ENST00000491302 A6NJ64 397 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-212ENST00000491302 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-212ENST00000491302 LECT2O14960 151 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-212ENST00000491302 STX10O60499 249 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-212ENST00000491302 HPGDSO60760 199 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-212ENST00000491302 CRABP1P29762 137 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-212ENST00000491302 GRPRP30550 384 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-212ENST00000491302 HLA-DRB5Q30154 266 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-212ENST00000491302 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-212ENST00000491302 NATD1Q8N6N6 113 aa3.83□□□□□ -1.8
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PTPRC-212ENST00000491302 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-212ENST00000491302 SNX10Q9Y5X0 201 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-212ENST00000491302 PLB1Q6P1J6 1458 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC7Q96NW7 1537 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-212ENST00000491302 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRC-212ENST00000491302 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
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