RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

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Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 CTSL3PQ5NE16 218 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 TSPO2Q5TGU0 170 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 MFSD5Q6N075 450 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 CES5AQ6NT32 575 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 REEP3Q6NUK4 255 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 UGT3A1Q6NUS8 523 aa-2.65□□□□□ -2.83
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SNORD54-201ENST00000459159 SLC36A4Q6YBV0 504 aa-2.65□□□□□ -2.83
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SNORD54-201ENST00000459159 TEX9Q8N6V9 391 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 STKLD1Q8NE28 680 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 OR4N2Q8NGD1 307 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 OR5M3Q8NGP4 307 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 OR6N1Q8NGY5 312 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 OR51Q1Q8NH59 317 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 OR9G1Q8NH87 305 aa-2.65□□□□□ -2.83
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SNORD54-201ENST00000459159 AP2M1Q96CW1 435 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 SENP8Q96LD8 212 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 KLHL15Q96M94 604 aa-2.65□□□□□ -2.83
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SNORD54-201ENST00000459159 MED18Q9BUE0 208 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 PRRG3Q9BZD7 231 aa-2.65□□□□□ -2.83
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SNORD54-201ENST00000459159 OR10A4Q9H209 315 aa-2.65□□□□□ -2.83
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SNORD54-201ENST00000459159 C1orf198Q9H425 327 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 SFXN1Q9H9B4 322 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 NMUR1Q9HB89 426 aa-2.65□□□□□ -2.83
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SNORD54-201ENST00000459159 CBLN4Q9NTU7 201 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 MED17Q9NVC6 651 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 RIC8BQ9NVN3 520 aa-2.65□□□□□ -2.83
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SNORD54-201ENST00000459159 NINJ2Q9NZG7 142 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 TBC1D7Q9P0N9 293 aa-2.65□□□□□ -2.83
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SNORD54-201ENST00000459159 PYCARDQ9ULZ3 195 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 PHF24Q9UPV7 400 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 HFM1A2PYH4 1435 aa-2.66□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa-2.66□□□□□ -2.83
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SNORD54-201ENST00000459159 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa-2.66□□□□□ -2.84
SNORD54-201ENST00000459159 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa-2.66□□□□□ -2.84
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SNORD54-201ENST00000459159 ARHGEF37A1IGU5 675 aa-2.66□□□□□ -2.84
SNORD54-201ENST00000459159 OR4C46A6NHA9 309 aa-2.66□□□□□ -2.84
SNORD54-201ENST00000459159 OR4C45A6NMZ5 311 aa-2.66□□□□□ -2.84
SNORD54-201ENST00000459159 A8MT66 165 aa-2.66□□□□□ -2.84
SNORD54-201ENST00000459159 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa-2.66□□□□□ -2.84
SNORD54-201ENST00000459159 H7C0C1 242 aa-2.66□□□□□ -2.84
SNORD54-201ENST00000459159 K7EQD1 137 aa-2.66□□□□□ -2.84
SNORD54-201ENST00000459159 LST1O00453 97 aa-2.66□□□□□ -2.84
SNORD54-201ENST00000459159 RER1O15258 196 aa-2.66□□□□□ -2.84
SNORD54-201ENST00000459159 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP-2.66□□□□□ -2.84
SNORD54-201ENST00000459159 SLC26A4O43511 780 aa-2.66□□□□□ -2.84
SNORD54-201ENST00000459159 COQ9O75208 318 aa-2.66□□□□□ -2.84
SNORD54-201ENST00000459159 SEC22BO75396 215 aa-2.66□□□□□ -2.84
SNORD54-201ENST00000459159 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP-2.66□□□□□ -2.84
SNORD54-201ENST00000459159 APOMO95445 188 aa-2.66□□□□□ -2.84
SNORD54-201ENST00000459159 ZBED1O96006 694 aa-2.66□□□□□ -2.84
SNORD54-201ENST00000459159 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP-2.66□□□□□ -2.84
SNORD54-201ENST00000459159 CRPP02741 224 aa-2.66□□□□□ -2.84
SNORD54-201ENST00000459159 ALDOBP05062 364 aa-2.66□□□□□ -2.84
SNORD54-201ENST00000459159 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP-2.66□□□□□ -2.84
SNORD54-201ENST00000459159 LDHBP07195 334 aaKnown RBP-2.66□□□□□ -2.84
SNORD54-201ENST00000459159 HARSP12081 509 aaKnown RBP-2.66□□□□□ -2.84
SNORD54-201ENST00000459159 F3P13726 295 aa-2.66□□□□□ -2.84
SNORD54-201ENST00000459159 GABRB1P18505 474 aa-2.66□□□□□ -2.84
SNORD54-201ENST00000459159 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP-2.66□□□□□ -2.84
SNORD54-201ENST00000459159 ASPAP45381 313 aa-2.66□□□□□ -2.84
SNORD54-201ENST00000459159 VPS41P49754 854 aa-2.66□□□□□ -2.84
SNORD54-201ENST00000459159 RAB5CP51148 216 aa-2.66□□□□□ -2.84
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM33P57088 247 aa-2.66□□□□□ -2.84
SNORD54-201ENST00000459159 RPS16P62249 146 aaKnown RBP-2.66□□□□□ -2.84
SNORD54-201ENST00000459159 ETF1P62495 437 aaKnown RBP-2.66□□□□□ -2.84
SNORD54-201ENST00000459159 RHAGQ02094 409 aa-2.66□□□□□ -2.84
SNORD54-201ENST00000459159 IL24Q13007 206 aa-2.66□□□□□ -2.84
SNORD54-201ENST00000459159 GAGE6Q13070 117 aa-2.66□□□□□ -2.84
SNORD54-201ENST00000459159 TLR1Q15399 786 aa-2.66□□□□□ -2.84
SNORD54-201ENST00000459159 MSMO1Q15800 293 aa-2.66□□□□□ -2.84
SNORD54-201ENST00000459159 DDB1Q16531 1140 aa-2.66□□□□□ -2.84
SNORD54-201ENST00000459159 STX1AQ16623 288 aa-2.66□□□□□ -2.84
SNORD54-201ENST00000459159 DUSP6Q16828 381 aa-2.66□□□□□ -2.84
SNORD54-201ENST00000459159 HSDL1Q3SXM5 330 aa-2.66□□□□□ -2.84
SNORD54-201ENST00000459159 UGT3A2Q3SY77 523 aa-2.66□□□□□ -2.84
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