RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPP1R2P9O14990 202 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 ALOX12BO75342 701 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 AGTP01019 485 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 CXCL10P02778 98 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 ASAH2BP0C7U1 165 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 SCGB1C2P0DMR2 95 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCNOP22674 350 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 MLF1P58340 268 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 FXYD4P59646 89 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM3AP98173 230 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR1Q1Q15612 314 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 NDUFA5Q16718 116 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 CEACAM21Q3KPI0 293 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 GCSAMLQ5JQS6 135 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPM1LQ5SGD2 360 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 WDR88Q6ZMY6 472 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 GBP6Q6ZN66 633 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 SSX7Q7RTT5 188 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 HOOK3Q86VS8 718 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 CLDND2Q8NHS1 167 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 SCGB1C1Q8TD33 95 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 MITD1Q8WV92 249 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 DTD2Q96FN9 168 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM19A4Q96LR4 140 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPA2Q9H2U2 334 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM231Q9H6L2 316 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 SNX12Q9UMY4 172 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 ALG5Q9Y673 324 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 FLT4P35916 1363 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 RFX7Q2KHR2 1363 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 PIK3R4Q99570 1358 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 CD300LBA8K4G0 201 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 J3KRW8 73 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCL16O15467 120 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 HSF2BPO75031 334 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZMPSTE24O75844 475 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 HPRT1P00492 218 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 ABHD2P08910 425 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 IL11P20809 199 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 BGNP21810 368 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 NPPCP23582 126 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 CD82P27701 267 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 CA5AP35218 305 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 SERPINB10P48595 397 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 PSMB2P49721 201 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 UBE2NLQ5JXB2 153 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 TPGS1Q6ZTW0 290 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 KCTD9Q7L273 389 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPATA12Q7Z6I5 190 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 CBLN2Q8IUK8 224 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR4D5Q8NGN0 318 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 SGTBQ96EQ0 304 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR2AG1Q9H205 316 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 RMND5AQ9H871 391 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 OPTCQ9UBM4 332 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 C15orf41Q9Y2V0 281 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 PKD1L2Q7Z442 2459 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 DNAH11Q96DT5 4516 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 CHD7Q9P2D1 2997 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 TANC1Q9C0D5 1861 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A1W2PPV9 198 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR11H12B2RN74 326 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 TXNDC9O14530 226 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 ACOX3O15254 700 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 SSX5O60225 188 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 CLDN11O75508 207 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYO1DO94832 1006 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCNB2O95067 398 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR5F1O95221 314 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 PTHP01270 115 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 NPYP01303 97 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 LTAP01374 205 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 RHOCP08134 193 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 METTL15P1P0C7V9 234 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 HSMCR30P0CW71 290 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 CAV3P56539 151 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 CLDN18P56856 261 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 GTF2BQ00403 316 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 BSPH1Q075Z2 132 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM31Q5JXX7 168 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa-2.53□□□□□ -2.81
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