RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384121.1

RNU6-890P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 890, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-890P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-890P-201ENST00000384121 DOK4Q8TEW6 326 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-890P-201ENST00000384121 NELFBQ8WX92 580 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-890P-201ENST00000384121 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-890P-201ENST00000384121 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-890P-201ENST00000384121 SUCNR1Q9BXA5 334 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-890P-201ENST00000384121 IL22Q9GZX6 179 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-890P-201ENST00000384121 HHLA3Q9XRX5 114 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-890P-201ENST00000384121 SLX4Q8IY92 1834 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-890P-201ENST00000384121 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP-0.35□□□□□ -2.46
RNU6-890P-201ENST00000384121 MYH11P35749 1972 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 SCN9AQ15858 1988 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 TRAV25A0A0B4J276 109 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 E7EWF7 191 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 FGF16O43320 207 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 ERLIN1O75477 346 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 UCHL1P09936 223 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 LIPCP11150 499 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 CRHBPP24387 322 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 RPS5P46782 204 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 LCN2P80188 198 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 PDGFRLQ15198 375 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 MAPK14Q16539 360 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 Q1T7F1 81 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 EBLN2Q6P2I7 272 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 OFCC1Q8IZS5 231 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 MBD3L1Q8WWY6 194 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 GALMQ96C23 342 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 VAT1Q99536 393 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 DOHHQ9BU89 302 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 VCX3BQ9H321 246 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 C11orf49Q9H6J7 331 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 LZTFL1Q9NQ48 299 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 BRWD1Q9NSI6 2320 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 LAMA4Q16363 1823 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 H3BSA7 217 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 I3L4J1 428 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 CIAO1O76071 339 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 FGF4P08620 206 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 CPN2P22792 545 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 PSMC5P62195 406 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 HBG1P69891 147 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 HBG2P69892 147 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 PDK2Q15119 407 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 OR9I1Q8NGQ6 314 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 FNDC9Q8TBE3 224 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 CYGBQ8WWM9 190 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 MIEN1Q9BRT3 115 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 EBPLQ9BY08 206 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 SNX12Q9UMY4 172 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 TRAPPC13A5PLN9 417 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 FAM183AA6NL82 134 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 OR5K4A6NMS3 321 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 B4DEV8 164 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 TSPOP30536 169 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 XCL1P47992 114 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 GABARAPL2P60520 117 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 TAL2Q16559 108 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 PROKR2Q8NFJ6 384 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 OR4P4Q8NGL7 312 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 DTD1Q8TEA8 209 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 ACBD6Q9BR61 282 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 ACOT13Q9NPJ3 140 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 HPCAL4Q9UM19 191 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 GRIN2BQ13224 1484 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 ATAD5Q96QE3 1844 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 GOLGA8TH3BQL2 631 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 CD8AP01732 235 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 IGKV5-2P06315 115 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 CD24P25063 80 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 ARR3P36575 388 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 MOGQ16653 247 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 C7orf65Q6ZTY9 151 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 A0A1W2PQD3 144 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 PSMD11O00231 422 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 WRBO00258 174 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 IGHV1-69P01742 117 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-890P-201ENST00000384121 SERPINA7P05543 415 aa-0.39□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms