RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362402.1

RNU6-349P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 349, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-349P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-349P-201ENST00000362402 PAFAH1B2P68402 229 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 HIST1H3AP68431 136 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 ARG2P78540 354 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 H3F3AP84243 136 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 CDK5Q00535 292 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 PSG4Q00888 419 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 HMGCS1Q01581 520 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 IFITM2Q01629 132 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 EMX2Q04743 252 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 SRYQ05066 204 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 MXD1Q05195 221 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 PRKCDQ05655 676 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 RGS1Q08116 209 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 AESQ08117 197 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 SLC10A7Q0GE19 358 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 ST3GAL4Q11206 333 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 STX4Q12846 297 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 ZNF154Q13106 437 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 STX5Q13190 355 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 ERCC8Q13216 396 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 IL15RAQ13261 267 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 SKP2Q13309 424 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 PMAIP1Q13794 54 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 FLOT2Q14254 428 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 CLINT1Q14677 625 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 ARL6IP1Q15041 203 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 OXA1LQ15070 435 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 PON3Q15166 354 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 QPRTQ15274 297 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 ANGPT1Q15389 498 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 RSU1Q15404 277 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 RGNQ15493 299 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 SLC9A3R2Q15599 337 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 OR1Q1Q15612 314 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 TRAM1Q15629 374 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 GRK1Q15835 563 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 PSMD5Q16401 504 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 CARTPTQ16568 116 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 NRF1Q16656 503 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 CLEC12BQ2HXU8 276 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 ZNF181Q2M3W8 571 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 HLA-DRB5Q30154 266 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 PLPPR5Q32ZL2 321 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 RFX4Q33E94 735 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 PARP15Q460N3 678 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 CCDC153Q494R4 210 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 ZNF404Q494X3 552 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 ZBED5Q49AG3 693 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 CCDC58Q4VC31 144 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 FAM74A3Q4VXF1 159 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 MORN2Q502X0 79 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 ZCWPW2Q504Y3 356 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 ACSM3Q53FZ2 586 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 TMEM97Q5BJF2 176 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 TMEM128Q5BJH2 165 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 PDZD11Q5EBL8 140 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 ACSBG2Q5FVE4 666 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 SOHLH1Q5JUK2 328 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 CLLU1OSQ5K130 101 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 PPM1LQ5SGD2 360 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 C1orf100Q5SVJ3 147 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 FAM201AQ5SY85 155 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 C1orf194Q5T5A4 169 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 AVPI1Q5T686 147 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 C6orf183Q5T699 404 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 IDNKQ5T6J7 187 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 FAM162BQ5T6X4 162 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 FAM27D1Q5T7N8 215 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 HES5Q5TA89 166 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 HES3Q5TGS1 186 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 HACD4Q5VWC8 232 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 TEX36Q5VZQ5 186 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 TMEM236Q5W0B7 351 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 Q5XG85 94 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 FAM104BQ5XKR9 115 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 LPCAT4Q643R3 524 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 ZFAND6Q6FIF0 208 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-349P-201ENST00000362402 GLYATQ6IB77 296 aa0.14□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms