RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa11.95□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa11.95□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 LIN7BQ9HAP6 207 aa11.95□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 SSR3Q9UNL2 185 aa11.95□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 HSD17B6O14756 317 aa11.94□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 CLEC2LP0C7M8 214 aa11.94□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 CD36P16671 472 aa11.94□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 MNDAP41218 407 aa11.94□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 ARHGDIBP52566 201 aa11.94□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 BLCAPP62952 87 aa11.94□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM95Q3KNT9 176 aa11.94□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM30BQ3MIR4 351 aa11.94□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 Q3ZCU0 254 aa11.94□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 CT45A1Q5HYN5 189 aa11.94□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa11.94□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF554Q86TJ5 538 aa11.94□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 Q8N2B8 174 aa11.94□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 DRAM1Q8N682 238 aa11.94□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 C8orf31Q8N9H6 132 aa11.94□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 CT45A3Q8NHU0 189 aa11.94□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 SGMS2Q8NHU3 365 aa11.94□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 CAPSLQ8WWF8 208 aa11.94□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 OCSTAMPQ9BR26 566 aa11.94□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 SLC25A33Q9BSK2 321 aa11.94□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 RAB9BQ9NP90 201 aa11.94□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 KCNIP1Q9NZI2 227 aa11.94□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 RAB22AQ9UL26 194 aa11.94□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 HSF4Q9ULV5 492 aa11.94□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa11.93□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 NOTOA8MTQ0 251 aa11.93□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 TNFAIP8O95379 198 aa11.93□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 RAB7AP51149 207 aa11.93□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 MORN2Q502X0 79 aa11.93□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 Q6ZTK2 550 aa11.93□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 KLHDC1Q8N7A1 406 aa11.93□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 TSPAN14Q8NG11 270 aa11.93□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 OR56B1Q8NGI3 324 aa11.93□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 OR2T6Q8NHC8 308 aa11.93□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 SETD6Q8TBK2 473 aa11.93□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa11.93□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 CENPOQ9BU64 300 aa11.93□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 OR2S2Q9NQN1 319 aa11.93□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 SERTAD4Q9NUC0 356 aa11.93□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 KCNK7Q9Y2U2 307 aa11.93□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 A0A087WXM4 84 aa11.92□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa11.92□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa11.92□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa11.92□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 OR2F2O95006 317 aa11.92□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 AMY1AP04745 511 aa11.92□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 AMY2AP04746 511 aa11.92□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 SDC2P34741 201 aa11.92□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 TGFBR1P36897 503 aa11.92□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 RANBP1P43487 201 aa11.92□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 HTD2P86397 168 aa11.92□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 C16orf82Q7Z2V1 217 aa11.92□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 OR8H3Q8N146 312 aa11.92□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 KCTD7Q96MP8 289 aa11.92□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF696Q9H7X3 374 aa11.92□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 JPT1Q9UK76 154 aa11.92□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 RAB27BO00194 218 aa11.91□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 RAB6AP20340 208 aa11.91□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 IL3RAP26951 378 aa11.91□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF137PP52743 207 aa11.91□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 HLA-DRB3P79483 266 aa11.91□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 MXD1Q05195 221 aa11.91□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 PRR31Q5SQ13 230 aa11.91□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 SFXN4Q6P4A7 337 aa11.91□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 MOB1BQ7L9L4 216 aa11.91□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 MOB3BQ86TA1 216 aa11.91□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 TPRA1Q86W33 373 aa11.91□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 THNSL2Q86YJ6 484 aa11.91□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 OR10R2Q8NGX6 335 aa11.91□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 IL1F10Q8WWZ1 152 aa11.91□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 GALMQ96C23 342 aa11.91□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa11.91□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 PRSS22Q9GZN4 317 aa11.91□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 C12orf4Q9NQ89 552 aa11.91□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 DAPK2Q9UIK4 370 aa11.91□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa11.9□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 TRIM64CA6NLI5 447 aa11.9□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 MFNGO00587 321 aa11.9□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 RRP9O43818 475 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 YPEL1O60688 119 aa11.9□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 IGKV1D-33P01593 117 aa11.9□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 IGKV1-33P01594 117 aa11.9□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 VSIG10L2P0DP72 767 aa11.9□□□□□ -0.5
CSAG1-201ENST00000361211 GNB3P16520 340 aa11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms