RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 GNMTQ14749 295 aa17.91■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 TMEM30BQ3MIR4 351 aa17.91■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 MORN2Q502X0 79 aa17.91■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 CT45A1Q5HYN5 189 aa17.91■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 IDNKQ5T6J7 187 aa17.91■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 OR10V1Q8NGI7 309 aa17.91■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 CT45A3Q8NHU0 189 aa17.91■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 OCSTAMPQ9BR26 566 aa17.91■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 ATG5Q9H1Y0 275 aa17.91■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 Q9N2K0 584 aa17.91■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 METTL21EPA6NDL7 271 aa17.9■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa17.9■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 SLC25A38Q96DW6 304 aa17.9■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 OR2S2Q9NQN1 319 aa17.9■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 MMP24Q9Y5R2 645 aa17.9■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 POM121CA8CG34 1229 aa17.89■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 OOSP1A8MZH6 123 aa17.89■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 TSPAN9O75954 239 aa17.89■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 CRYBA1P05813 215 aa17.89■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 CD24P25063 80 aa17.89■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 CEACAM3P40198 252 aa17.89■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 RAG2P55895 527 aa17.89■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 SCAND1P57086 179 aa17.89■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 VBP1P61758 197 aa17.89■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 CTF1Q16619 201 aa17.89■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 C12orf54Q6X4T0 127 aa17.89■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa17.89■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 RAB9BQ9NP90 201 aa17.89■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 C12orf4Q9NQ89 552 aa17.89■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP17.89■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 GNG12Q9UBI6 72 aa17.89■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PPI3 338 aa17.88■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa17.88■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 YPEL1O60688 119 aa17.88■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 MADCAM1Q13477 382 aa17.88■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 LY6G6FQ5SQ64 297 aa17.88■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 MOB1BQ7L9L4 216 aa17.88■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 TMEM219Q86XT9 240 aa17.88■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 OR10X1Q8NGY0 326 aa17.88■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 LINC01006Q8NI28 216 aa17.88■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 CFHR4Q92496 578 aa17.88■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 GALMQ96C23 342 aa17.88■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 YPEL2Q96QA6 119 aa17.88■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 ABCB10Q9NRK6 738 aa17.88■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 RHBDL2Q9NX52 303 aa17.88■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 JPT1Q9UK76 154 aa17.88■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 TMEM127O75204 238 aa17.87■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 GABARAPO95166 117 aa17.87■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 SCTP09683 121 aa17.87■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 CDNFQ49AH0 187 aa17.87■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 STEAP3Q658P3 488 aa17.87■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 LIAT1Q6ZQX7 453 aa17.87■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 SETD6Q8TBK2 473 aa17.87■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 RPEQ96AT9 228 aa17.87■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 C16orf95Q9H693 158 aa17.87■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 SPATA2Q9UM82 520 aa17.87■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 ETV7Q9Y603 341 aa17.87■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 A0A075B6Q4 140 aa17.86■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa17.86■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 SERPINE3A8MV23 424 aa17.86■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 ZNF137PP52743 207 aa17.86■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 HLA-DRB3P79483 266 aa17.86■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 ZNF260Q3ZCT1 412 aa17.86■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 ODF3L1Q8IXM7 274 aa17.86■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 OR4F5Q8NH21 305 aa17.86■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 TOMM40LQ969M1 308 aa17.86■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 SLC25A46Q96AG3 418 aa17.86■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 ABRACLQ9P1F3 81 aa17.86■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 TIMM23O14925 209 aa17.85■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 FCGR3AP08637 254 aa17.85■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 CD3GP09693 182 aa17.85■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 SERPINB10P48595 397 aa17.85■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 HERPUD1Q15011 391 aa17.85■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 GPR107Q5VW38 600 aa17.85■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa17.85■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 CROCCP3Q8IVE0 287 aa17.85■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 IL1F10Q8WWZ1 152 aa17.85■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 CLPSL1A2RUU4 121 aa17.84■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 HSD17B6O14756 317 aa17.84■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 BRS3P32247 399 aa17.84■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 RAB7AP51149 207 aa17.84■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 DRAM1Q8N682 238 aa17.84■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 ZNF747Q9BV97 191 aa17.84■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 BEX1Q9HBH7 125 aa17.84■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 PITPNC1Q9UKF7 332 aa17.84■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 MGAT4AQ9UM21 535 aa17.84■□□□□ 0.45
SYF2-201ENST00000236273 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa17.83■□□□□ 0.44
SYF2-201ENST00000236273 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.4 ms