RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596522.1

FCHO1-215, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 4

Gene FCHO1, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-215	ENST00000596522	OOSP1	A8MZH6	123 aa		11.53	□□□□□ -0.56
FCHO1-215	ENST00000596522	C12orf77	C9JDV5	145 aa		11.53	□□□□□ -0.56
FCHO1-215	ENST00000596522	C15orf65	H3BRN8	121 aa		11.53	□□□□□ -0.56
FCHO1-215	ENST00000596522	RAB27B	O00194	218 aa		11.53	□□□□□ -0.56
FCHO1-215	ENST00000596522	RGS11	O94810	467 aa		11.53	□□□□□ -0.56
FCHO1-215	ENST00000596522	VENTX	O95231	258 aa		11.53	□□□□□ -0.56
FCHO1-215	ENST00000596522	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	11.53	□□□□□ -0.56
FCHO1-215	ENST00000596522	CD3G	P09693	182 aa		11.53	□□□□□ -0.56
FCHO1-215	ENST00000596522	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	11.53	□□□□□ -0.56
FCHO1-215	ENST00000596522	NFYB	P25208	207 aa		11.53	□□□□□ -0.56
FCHO1-215	ENST00000596522	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	11.53	□□□□□ -0.56
FCHO1-215	ENST00000596522	RORC	P51449	518 aa		11.53	□□□□□ -0.56
FCHO1-215	ENST00000596522	EFNB2	P52799	333 aa		11.53	□□□□□ -0.56
FCHO1-215	ENST00000596522	VBP1	P61758	197 aa		11.53	□□□□□ -0.56
FCHO1-215	ENST00000596522	PITPNA	Q00169	270 aa		11.53	□□□□□ -0.56
FCHO1-215	ENST00000596522	CTF1	Q16619	201 aa		11.53	□□□□□ -0.56
FCHO1-215	ENST00000596522	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		11.53	□□□□□ -0.56
FCHO1-215	ENST00000596522	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	11.53	□□□□□ -0.56
FCHO1-215	ENST00000596522	NDNF	Q8TB73	568 aa		11.53	□□□□□ -0.56
FCHO1-215	ENST00000596522	CCDC107	Q8WV48	283 aa		11.53	□□□□□ -0.56
FCHO1-215	ENST00000596522	DYRK2	Q92630	601 aa		11.53	□□□□□ -0.56
FCHO1-215	ENST00000596522	GALM	Q96C23	342 aa		11.53	□□□□□ -0.56
FCHO1-215	ENST00000596522	CMTM3	Q96MX0	182 aa		11.53	□□□□□ -0.56
FCHO1-215	ENST00000596522	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	11.53	□□□□□ -0.56
FCHO1-215	ENST00000596522	DIABLO	Q9NR28	239 aa		11.53	□□□□□ -0.56
FCHO1-215	ENST00000596522	AK3	Q9UIJ7	227 aa		11.53	□□□□□ -0.56
FCHO1-215	ENST00000596522	JPT1	Q9UK76	154 aa		11.53	□□□□□ -0.56
FCHO1-215	ENST00000596522		A0A0B4J203	849 aa		11.52	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		11.52	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	LEUTX	A8MZ59	168 aa		11.52	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	11.52	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	MFNG	O00587	321 aa		11.52	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	DIRAS3	O95661	229 aa		11.52	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	IGLV1-47	P01700	117 aa		11.52	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	11.52	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	MELTF	P08582	738 aa		11.52	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	OMG	P23515	440 aa		11.52	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	IL3RA	P26951	378 aa		11.52	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	SOX6	P35712	828 aa		11.52	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	KIR2DS4	P43632	304 aa		11.52	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	TMEM50B	P56557	158 aa		11.52	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	HTD2	P86397	168 aa		11.52	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	KIR2DS1	Q14954	304 aa		11.52	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	HMGN3	Q15651	99 aa		11.52	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	11.52	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		11.52	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		11.52	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		11.52	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		11.52	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		11.52	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	11.52	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		11.52	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		11.52	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	MMP28	Q9H239	520 aa		11.52	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		11.52	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		11.52	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		11.52	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	DPM3	Q9P2X0	92 aa		11.52	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	GNG12	Q9UBI6	72 aa		11.52	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522		A0A1W2PRD5	423 aa		11.51	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522		A0A1W2PRF3	423 aa		11.51	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522		A0A1W2PRM7	423 aa		11.51	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	VGLL3	A8MV65	326 aa		11.51	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	MMP23A	O75900	390 aa		11.51	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	HBZ	P02008	142 aa		11.51	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	LPL	P06858	475 aa		11.51	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	DTYMK	P23919	212 aa		11.51	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	TALDO1	P37837	337 aa		11.51	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	IER3	P46695	156 aa		11.51	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	DLX1	P56177	255 aa		11.51	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	ARFRP1	Q13795	201 aa		11.51	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		11.51	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		11.51	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		11.51	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	MZT2A	Q6P582	158 aa		11.51	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	LINC00311	Q8N616	119 aa		11.51	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		11.51	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		11.51	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	RFESD	Q8TAC1	157 aa		11.51	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	ABCG5	Q9H222	651 aa		11.51	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		11.51	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	RAB18	Q9NP72	206 aa		11.51	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		11.51	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522		J3QR06	171 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	TGFBR1	P36897	503 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	MNDA	P41218	407 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	DYNLT3	P51808	116 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	HLA-DRB3	P79483	266 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	PLA2G7	Q13093	441 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	MADCAM1	Q13477	382 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	HACD4	Q5VWC8	232 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	PRR18	Q8N4B5	295 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FCHO1-215	ENST00000596522	DTX3	Q8N9I9	347 aa		11.5	□□□□□ -0.57

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