RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588551.5

POP4-208, Transcript of POP4 homolog, ribonuclease P/MRP subunit, human

TSL 3

Gene POP4, Length 789 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POP4-208	ENST00000588551	PSG11	Q9UQ72	335 aa		11.16	□□□□□ -0.62
POP4-208	ENST00000588551	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		11.16	□□□□□ -0.62
POP4-208	ENST00000588551		J3QR06	171 aa		11.15	□□□□□ -0.62
POP4-208	ENST00000588551	RAB27B	O00194	218 aa		11.15	□□□□□ -0.62
POP4-208	ENST00000588551	AIRE	O43918	545 aa		11.15	□□□□□ -0.62
POP4-208	ENST00000588551	GPR137B	O60478	399 aa		11.15	□□□□□ -0.62
POP4-208	ENST00000588551	RAB6A	P20340	208 aa		11.15	□□□□□ -0.62
POP4-208	ENST00000588551	HTR1D	P28221	377 aa		11.15	□□□□□ -0.62
POP4-208	ENST00000588551	RAB13	P51153	203 aa		11.15	□□□□□ -0.62
POP4-208	ENST00000588551	PRRX1	P54821	245 aa		11.15	□□□□□ -0.62
POP4-208	ENST00000588551	ACTG1	P63261	375 aa		11.15	□□□□□ -0.62
POP4-208	ENST00000588551	RELB	Q01201	579 aa		11.15	□□□□□ -0.62
POP4-208	ENST00000588551	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		11.15	□□□□□ -0.62
POP4-208	ENST00000588551	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		11.15	□□□□□ -0.62
POP4-208	ENST00000588551	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		11.15	□□□□□ -0.62
POP4-208	ENST00000588551	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		11.15	□□□□□ -0.62
POP4-208	ENST00000588551	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		11.15	□□□□□ -0.62
POP4-208	ENST00000588551		Q6ZTK2	550 aa		11.15	□□□□□ -0.62
POP4-208	ENST00000588551	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		11.15	□□□□□ -0.62
POP4-208	ENST00000588551	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		11.15	□□□□□ -0.62
POP4-208	ENST00000588551	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		11.15	□□□□□ -0.62
POP4-208	ENST00000588551	OR9G1	Q8NH87	305 aa		11.15	□□□□□ -0.62
POP4-208	ENST00000588551	OR1L1	Q8NH94	360 aa		11.15	□□□□□ -0.62
POP4-208	ENST00000588551	ZNF596	Q8TC21	504 aa		11.15	□□□□□ -0.62
POP4-208	ENST00000588551	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
POP4-208	ENST00000588551	PTX4	Q96A99	478 aa		11.15	□□□□□ -0.62
POP4-208	ENST00000588551	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		11.15	□□□□□ -0.62
POP4-208	ENST00000588551	PECR	Q9BY49	303 aa		11.15	□□□□□ -0.62
POP4-208	ENST00000588551	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		11.15	□□□□□ -0.62
POP4-208	ENST00000588551	DPM3	Q9P2X0	92 aa		11.15	□□□□□ -0.62
POP4-208	ENST00000588551	AK3	Q9UIJ7	227 aa		11.15	□□□□□ -0.62
POP4-208	ENST00000588551	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		11.15	□□□□□ -0.62
POP4-208	ENST00000588551	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		11.14	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551		H3BUX3	64 aa		11.14	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	TOR1A	O14656	332 aa		11.14	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	HBZ	P02008	142 aa		11.14	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	FAM189A2	Q15884	450 aa		11.14	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	PLA1A	Q53H76	456 aa		11.14	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	C6orf183	Q5T699	404 aa		11.14	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		11.14	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	OR5R1	Q8NH85	324 aa		11.14	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	NDNF	Q8TB73	568 aa		11.14	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	MMP28	Q9H239	520 aa		11.14	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		11.14	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	C1RL	Q9NZP8	487 aa		11.14	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		11.14	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		11.13	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		11.13	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551		A0A1W2PPE3	182 aa		11.13	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	LEUTX	A8MZ59	168 aa		11.13	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	SPINT2	O43291	252 aa		11.13	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	TFAP2A	P05549	437 aa		11.13	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		11.13	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	DYNLT3	P51808	116 aa		11.13	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		11.13	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		11.13	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		11.13	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	BTBD17	A6NE02	478 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	GNB3	P16520	340 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	ALDH3B2	P48448	385 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	GNG10	P50151	68 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	ZNF134	P52741	427 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	HMGN3	Q15651	99 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	LY6E	Q16553	131 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	AWAT1	Q58HT5	328 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	PRR18	Q8N4B5	295 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	RAB3C	Q96E17	227 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		11.12	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551		A6NDX4	124 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	MFNG	O00587	321 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	SLC31A2	O15432	143 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	NCS1	P62166	190 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	IDNK	Q5T6J7	187 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	LINC00311	Q8N616	119 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		11.11	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
POP4-208	ENST00000588551	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		11.11	□□□□□ -0.63

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