RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555017.5

SEC23A-208, Transcript of Sec23 homolog A, coat complex II component, human

TSL 4

Gene SEC23A, Length 588 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEC23A-208	ENST00000555017	PPIAL4D	F5H284	164 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	DVL1	O14640	695 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	ADAM20	O43506	726 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	ZNF737	O75373	536 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	IGHV2-70	P01814	119 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	APOA1	P02647	267 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	IGKV2-30	P06310	120 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	CD55	P08174	381 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	SCT	P09683	121 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	GSTT2	P0CG29	244 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	GSTT2B	P0CG30	244 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	LYL1	P12980	280 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	IL7	P13232	177 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	GTF2F2	P13984	249 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	CCL3L1	P16619	93 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	OMG	P23515	440 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	RFX2	P48378	723 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	PSMD7	P51665	324 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	CCR6	P51684	374 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	ATP5J2	P56134	94 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	FGF12	P61328	243 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	ARFRP1	Q13795	201 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	GPR176	Q14439	515 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	ZNF273	Q14593	569 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	GNMT	Q14749	295 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	HERPUD1	Q15011	391 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	IGSF11	Q5DX21	431 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	STUM	Q69YW2	141 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	ELP2	Q6IA86	826 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	ZNF573	Q86YE8	665 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017		Q8NFD4	153 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	PXT1	Q8NFP0	134 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	OR1L1	Q8NH94	360 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	ST8SIA4	Q92187	359 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	SNAPC3	Q92966	411 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	TRIM63	Q969Q1	353 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	SPSB1	Q96BD6	273 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	C10orf35	Q96D05	121 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	RAB3C	Q96E17	227 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	S100A13	Q99584	98 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	CCL19	Q99731	98 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	TM2D1	Q9BX74	207 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	BEX2	Q9BXY8	128 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	ABCG5	Q9H222	651 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	MMP28	Q9H239	520 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	BEX1	Q9HBH7	125 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	MMP26	Q9NRE1	261 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	IL19	Q9UHD0	177 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	RAB22A	Q9UL26	194 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	RNF150	Q9ULK6	438 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	LRRK2	Q5S007	2527 aa		2.58	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		2.57	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	CXorf65	A6NEN9	183 aa		2.57	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	OOEP	A6NGQ2	149 aa		2.57	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	TMEM210	A6NLX4	147 aa		2.57	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		2.57	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	CLDN25	C9JDP6	229 aa		2.57	□□□□□ -2
SEC23A-208	ENST00000555017	LGALS8	O00214	317 aa		2.57	□□□□□ -2

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