RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540221.1

PXN-209, Transcript of paxillin, humanhuman

TSL 4

Gene PXN, Length 550 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXN-209ENST00000540221 SHISA3A0PJX4 238 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 UBE2QL1A1L167 161 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 SERPINE3A8MV23 424 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 H3BUX3 64 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 J3QR06 171 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 AIREO43918 545 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 GPR137BO60478 399 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 MMP23AO75900 390 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 IL3RAP26951 378 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 SDC2P34741 201 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 SSTR5P35346 364 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 VEGFCP49767 419 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 RAB7AP51149 207 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 CLDN12P56749 244 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 HTD2P86397 168 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 MADCAM1Q13477 382 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 SSX2Q16385 188 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 LY6G6FQ5SQ64 297 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 SFXN4Q6P4A7 337 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 C11orf88Q6PI97 169 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 C16orf82Q7Z2V1 217 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 C6orf201Q7Z4U5 140 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 LINC00311Q8N616 119 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 OR10X1Q8NGY0 326 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 OR4K15Q8NH41 348 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 RFESDQ8TAC1 157 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 CCDC107Q8WV48 283 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 GALMQ96C23 342 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 RAB3CQ96E17 227 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 YIPF6Q96EC8 236 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 AJUBAQ96IF1 538 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 SULT4A1Q9BR01 284 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 OCSTAMPQ9BR26 566 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 FAAP24Q9BTP7 215 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 GHITMQ9H3K2 345 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 TAF9BQ9HBM6 251 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 ZNF286AQ9HBT8 521 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 C12orf4Q9NQ89 552 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 GFOD1Q9NXC2 390 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 ZNF581Q9P0T4 197 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 GNG12Q9UBI6 72 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 JPT1Q9UK76 154 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 PSG11Q9UQ72 335 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 ETV7Q9Y603 341 aa7.35□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 A0A0A6YYH2 397 aa7.34□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 A6NJ64 397 aa7.34□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 C12orf77C9JDV5 145 aa7.34□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 SOCS1O15524 211 aa7.34□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 TXNL1O43396 289 aa7.34□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 DIRAS3O95661 229 aa7.34□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 NAPSAO96009 420 aa7.34□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 HBZP02008 142 aa7.34□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 RAG2P55895 527 aa7.34□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 OR10A3P58181 314 aa7.34□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa7.34□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 OR8H3Q8N146 312 aa7.34□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 C3orf56Q8N813 242 aa7.34□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 OR10R2Q8NGX6 335 aa7.34□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 RPEQ96AT9 228 aa7.34□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 PHF21AQ96BD5 680 aa7.34□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 NICN1Q9BSH3 213 aa7.34□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 OR2S2Q9NQN1 319 aa7.34□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 TNFRSF19Q9NS68 423 aa7.34□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 DAPK2Q9UIK4 370 aa7.34□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 TCF19Q9Y242 345 aa7.34□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 HILPDAQ9Y5L2 63 aa7.34□□□□□ -1.23
PXN-209ENST00000540221 A0A0A6YYD4 124 aa7.33□□□□□ -1.24
PXN-209ENST00000540221 CLPSL1A2RUU4 121 aa7.33□□□□□ -1.24
PXN-209ENST00000540221 LY6LH3BQJ8 138 aa7.33□□□□□ -1.24
PXN-209ENST00000540221 YPEL1O60688 119 aa7.33□□□□□ -1.24
PXN-209ENST00000540221 TSPAN9O75954 239 aa7.33□□□□□ -1.24
PXN-209ENST00000540221 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PXN-209ENST00000540221 CD3GP09693 182 aa7.33□□□□□ -1.24
PXN-209ENST00000540221 FAM106CPP0CH98 169 aa7.33□□□□□ -1.24
PXN-209ENST00000540221 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PXN-209ENST00000540221 GDNFP39905 211 aa7.33□□□□□ -1.24
PXN-209ENST00000540221 KIR2DS4P43632 304 aa7.33□□□□□ -1.24
PXN-209ENST00000540221 TMEM50BP56557 158 aa7.33□□□□□ -1.24
PXN-209ENST00000540221 LOXL3P58215 753 aa7.33□□□□□ -1.24
PXN-209ENST00000540221 PITPNAQ00169 270 aa7.33□□□□□ -1.24
PXN-209ENST00000540221 KIR2DS1Q14954 304 aa7.33□□□□□ -1.24
PXN-209ENST00000540221 HMGN3Q15651 99 aa7.33□□□□□ -1.24
PXN-209ENST00000540221 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP7.33□□□□□ -1.24
PXN-209ENST00000540221 AWAT1Q58HT5 328 aa7.33□□□□□ -1.24
PXN-209ENST00000540221 ZNF880Q6PDB4 577 aa7.33□□□□□ -1.24
PXN-209ENST00000540221 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PXN-209ENST00000540221 THNSL2Q86YJ6 484 aa7.33□□□□□ -1.24
PXN-209ENST00000540221 OR4C13Q8NGP0 309 aa7.33□□□□□ -1.24
PXN-209ENST00000540221 OR13F1Q8NGS4 319 aa7.33□□□□□ -1.24
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