RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515575.1

RPS4Y1-204, Transcript of ribosomal protein S4 Y-linked 1, human

TSL 3

Gene RPS4Y1, Length 454 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS4Y1-204	ENST00000515575	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	KRT222	Q8N1A0	295 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	ZNF321P	Q8N8H1	164 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	HBEGF	Q99075	208 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	SYT4	Q9H2B2	425 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	UCK1	Q9HA47	277 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	KIF27	Q86VH2	1401 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	CRB1	P82279	1406 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	RAB19	A4D1S5	217 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	TMEM210	A6NLX4	147 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	IQCF5	A8MTL0	148 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	PHYH	O14832	338 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	SLC16A4	O15374	487 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	CYTH3	O43739	400 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	SCN2B	O60939	215 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	UGT2B11	O75310	529 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	VAPB	O95292	243 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	GUSB	P08236	651 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	GIMD1	P0DJR0	217 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	NQO2	P16083	231 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	ELK4	P28324	431 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	XK	P51811	444 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	SKP1	P63208	163 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	FADD	Q13158	208 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	APOF	Q13790	326 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	MMD	Q15546	238 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	RESP18	Q5W5W9	173 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	COPS6	Q7L5N1	327 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	OR7G1	Q8NGA0	311 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	DOK4	Q8TEW6	326 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	MED10	Q9BTT4	135 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	DRC3	Q9H069	523 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	VCX3B	Q9H321	246 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	TREM1	Q9NP99	234 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	SPANXC	Q9NY87	97 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	NCOA1	Q15788	1441 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	PLPP3	O14495	311 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	ITGB1BP1	O14713	200 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	UBD	O15205	165 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	TCF21	O43680	179 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	KDELR3	O43731	214 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	SSNA1	O43805	119 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	PFDN1	O60925	122 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	CA2	P00918	260 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	CST4	P01036	141 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	GYPC	P04921	128 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	CCL2	P13500	99 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	MYL12A	P19105	171 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RPS4Y1-204	ENST00000515575	SYT1	P21579	422 aa		0.92	□□□□□ -2.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms