RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC22A24Q8N4F4 322 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 C9orf106Q8NAJ2 232 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 C4orf45Q96LM5 186 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 CST9LQ9H4G1 147 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 RNF150Q9ULK6 438 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 ST3GAL6Q9Y274 331 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A0B4J2A0 478 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 M0QZ24 198 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 PRRG2O14669 202 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 OR5H8P0DN80 308 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 ATF1P18846 271 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 CD34P28906 385 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 PSMB10P40306 273 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 PDLIM4P50479 330 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 ATP1B3P54709 279 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 SLAQ13239 276 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 BATFQ16520 125 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 BSXQ3C1V8 233 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 PLXDC2Q6UX71 529 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 RPTNQ6XPR3 784 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 IZUMO1Q8IYV9 350 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 OR10S1Q8NGN2 331 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM106AQ96A25 262 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 ACY3Q96HD9 319 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 PBDC1Q9BVG4 233 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 CNTD2Q9H8S5 307 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 FKBP11Q9NYL4 201 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 SHPKQ9UHJ6 478 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 OR4C45A6NMZ5 311 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 CDIPTO14735 213 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 TAAR5O14804 337 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 AGPAT2O15120 278 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 TSPAN15O95858 294 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 WNT11O96014 354 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM225BP0DP42 221 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 PGAM2P15259 253 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 SRMP19623 302 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 BMP5P22003 454 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 TFPI2P48307 235 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 ARF1P84077 181 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 RTL6Q6ICC9 239 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 ANKRD16Q6P6B7 361 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 GFRALQ6UXV0 394 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 CEACAM19Q7Z692 300 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 COMMD2Q86X83 199 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 OR13C5Q8NGS8 318 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 OR5AK2Q8NH90 309 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 ABHD4Q8TB40 342 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 RAB40AQ8WXH6 277 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 MOB3AQ96BX8 217 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC25A38Q96DW6 304 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 SNX22Q96L94 193 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 CENPMQ9NSP4 180 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 FRRS1LQ9P0K9 344 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 PRSS50Q9UI38 385 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM215AQ9Y5M1 114 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 COX11Q9Y6N1 276 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 RNF212BA8MTL3 300 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 K7EPK0 472 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 ARL6IP5O75915 188 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 IL2RAP01589 272 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 ISG15P05161 165 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 OR5G3P0C626 314 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 B4GALT1P15291 398 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 COX5AP20674 150 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 GLIPR1P48060 266 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 TGFBR3Q03167 851 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 C5orf64Q2M2E5 130 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 WDR38Q5JTN6 314 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 OTPQ5XKR4 325 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 Q6ZRG5 221 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 Q6ZT83 130 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 SEM1Q6ZVN7 128 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 BIVMQ86UB2 503 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 CMTM1Q8IZ96 169 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 OR1K1Q8NGR3 316 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 OR4S2Q8NH73 311 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 LGALS14Q8TCE9 139 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 SFXN3Q9BWM7 321 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-211ENST00000493660 SCRT1Q9BWW7 348 aa6.22□□□□□ -1.41
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