RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489601.1

SH3BP4-210, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 638 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-210ENST00000489601 OR8H1Q8NGG4 311 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 OR8U1Q8NH10 309 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 S1PR3Q99500 378 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 RASL11BQ9BPW5 248 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 A0A1W2PP11 408 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 AIPO00170 330 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 RRP9O43818 475 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 WBP4O75554 376 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 IGHV3-43DP0DP04 118 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 VSIG8P0DPA2 414 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 ETV1P50549 477 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 CFHR3Q02985 330 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 GPR176Q14439 515 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM30BQ3MIR4 351 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 OR2G6Q5TZ20 316 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 STX19Q8N4C7 294 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF439Q8NDP4 499 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 UBALD1Q8TB05 177 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 NEK7Q8TDX7 302 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 TFAP2CQ92754 450 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 SMIM19Q96E16 107 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 SPACA1Q9HBV2 294 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 RAB9BQ9NP90 201 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF580Q9UK33 172 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa12.99□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 IGHG4P01861 327 aa12.99□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 VHLP40337 213 aa12.99□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 RAB25P57735 213 aa12.99□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 RIPK1Q13546 671 aa12.99□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 SLC22A6Q4U2R8 563 aa12.99□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 C9orf66Q5T8R8 295 aa12.99□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 LCNL1Q6ZST4 164 aa12.99□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa12.99□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 OR5M8Q8NGP6 311 aa12.99□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 ORAI1Q96D31 301 aa12.99□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 BABAM2Q9NXR7 383 aa12.99□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 SORL1Q92673 2214 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 IRGMA1A4Y4 181 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 C12orf77C9JDV5 145 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 MCRIP1C9JLW8 97 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 SLC31A2O15432 143 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 SPINT2O43291 252 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF134P52741 427 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 F2RL1P55085 397 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 DEFB136Q30KP8 78 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 CT45A1Q5HYN5 189 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 STEAP3Q658P3 488 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 GAPTQ8N292 157 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 OR13C5Q8NGS8 318 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 CT45A3Q8NHU0 189 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 S100A14Q9HCY8 104 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 LALBAP00709 142 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 IGF1P05019 195 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 VDAC1P21796 283 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 PSMB8P28062 276 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 SOX6P35712 828 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 LUMP51884 338 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP12.97□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 Q499Y3 187 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 C6orf183Q5T699 404 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 TRAT1Q6PIZ9 186 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 PQLC1Q8N2U9 271 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF555Q8NEP9 628 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 GHSRQ92847 366 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 RDH12Q96NR8 316 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 HSPB9Q9BQS6 159 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 ETAA1Q9NY74 926 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 GNG12Q9UBI6 72 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 MAGEA13PA6NCF6 341 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 LANCL1O43813 399 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 HBZP02008 142 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 OR5H8P0DN80 308 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 FSTP19883 344 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 FHL3Q13643 280 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 YIF1BQ5BJH7 314 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 CDH26Q8IXH8 852 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 OR4K15Q8NH41 348 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 C4orf3Q8WVX3 66 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 CKLFQ9UBR5 152 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 SCOCQ9UIL1 159 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP4-210ENST00000489601 FAM90A10PA6NDY2 464 aa12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.4 ms