RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485765.5

NISCH-209, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-209ENST00000485765 LINC00311Q8N616 119 aa15.28■□□□□ 0.04
NISCH-209ENST00000485765 NEDD4LQ96PU5 975 aa15.28■□□□□ 0.04
NISCH-209ENST00000485765 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa15.28■□□□□ 0.04
NISCH-209ENST00000485765 LPAR5Q9H1C0 372 aa15.28■□□□□ 0.04
NISCH-209ENST00000485765 KCNK15Q9H427 330 aa15.28■□□□□ 0.04
NISCH-209ENST00000485765 PLGRKTQ9HBL7 147 aa15.28■□□□□ 0.04
NISCH-209ENST00000485765 GFOD1Q9NXC2 390 aa15.28■□□□□ 0.04
NISCH-209ENST00000485765 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
NISCH-209ENST00000485765 A0A0A6YYD4 124 aa15.27■□□□□ 0.04
NISCH-209ENST00000485765 SHISA3A0PJX4 238 aa15.27■□□□□ 0.04
NISCH-209ENST00000485765 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa15.27■□□□□ 0.04
NISCH-209ENST00000485765 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
NISCH-209ENST00000485765 RANBP1P43487 201 aa15.27■□□□□ 0.04
NISCH-209ENST00000485765 EFNB2P52799 333 aa15.27■□□□□ 0.04
NISCH-209ENST00000485765 P2RY14Q15391 338 aa15.27■□□□□ 0.04
NISCH-209ENST00000485765 RAB11BQ15907 218 aa15.27■□□□□ 0.04
NISCH-209ENST00000485765 PRR31Q5SQ13 230 aa15.27■□□□□ 0.04
NISCH-209ENST00000485765 C6orf183Q5T699 404 aa15.27■□□□□ 0.04
NISCH-209ENST00000485765 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa15.27■□□□□ 0.04
NISCH-209ENST00000485765 TRAT1Q6PIZ9 186 aa15.27■□□□□ 0.04
NISCH-209ENST00000485765 ZNF554Q86TJ5 538 aa15.27■□□□□ 0.04
NISCH-209ENST00000485765 TMEM219Q86XT9 240 aa15.27■□□□□ 0.04
NISCH-209ENST00000485765 OR4C13Q8NGP0 309 aa15.27■□□□□ 0.04
NISCH-209ENST00000485765 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
NISCH-209ENST00000485765 SULT4A1Q9BR01 284 aa15.27■□□□□ 0.04
NISCH-209ENST00000485765 NICN1Q9BSH3 213 aa15.27■□□□□ 0.04
NISCH-209ENST00000485765 FAAP24Q9BTP7 215 aa15.27■□□□□ 0.04
NISCH-209ENST00000485765 RAB9BQ9NP90 201 aa15.27■□□□□ 0.04
NISCH-209ENST00000485765 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 LDLRAD4O15165 306 aa15.26■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 SPINT2O43291 252 aa15.26■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 ARHGDIBP52566 201 aa15.26■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 MADCAM1Q13477 382 aa15.26■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 C2orf76Q3KRA6 126 aa15.26■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 TMEM30BQ3MIR4 351 aa15.26■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 C11orf88Q6PI97 169 aa15.26■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 C6orf201Q7Z4U5 140 aa15.26■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 THNSL2Q86YJ6 484 aa15.26■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 OR51D1Q8NGF3 324 aa15.26■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 UBALD1Q8TB05 177 aa15.26■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 FAM3DQ96BQ1 224 aa15.26■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 ZNF702PQ9H963 129 aa15.26■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 SIGLEC9Q9Y336 463 aa15.26■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 PDCD5O14737 125 aa15.25■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 HBZP02008 142 aa15.25■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 PSMB9P28065 219 aa15.25■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 GNG10P50151 68 aa15.25■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 NKAPLQ5M9Q1 402 aa15.25■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 C16orf82Q7Z2V1 217 aa15.25■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 RPEQ96AT9 228 aa15.25■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 OCSTAMPQ9BR26 566 aa15.25■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 LIN7BQ9HAP6 207 aa15.25■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 TAF9BQ9HBM6 251 aa15.25■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 STEAP1Q9UHE8 339 aa15.25■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 CMYA5Q8N3K9 4069 aa15.24■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 SOCS1O15524 211 aa15.24■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 CD24P25063 80 aa15.24■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 MNDAP41218 407 aa15.24■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 TMEM50BP56557 158 aa15.24■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 CLDN12P56749 244 aa15.24■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa15.24■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 KCTD21Q4G0X4 260 aa15.24■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 FBLN7Q53RD9 439 aa15.24■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 ZNF880Q6PDB4 577 aa15.24■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 ZNF439Q8NDP4 499 aa15.24■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 OR1L1Q8NH94 360 aa15.24■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 OR2T6Q8NHC8 308 aa15.24■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 TOMM40LQ969M1 308 aa15.24■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa15.24■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa15.24■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 HSF4Q9ULV5 492 aa15.24■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa15.23■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 A0A1W2PPE3 182 aa15.23■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 A0A1W2PPI3 338 aa15.23■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 IFITM5A6NNB3 132 aa15.23■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 NAPSAO96009 420 aa15.23■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 IGHV3-43DP0DP04 118 aa15.23■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 RAB7AP51149 207 aa15.23■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 OR10A3P58181 314 aa15.23■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 BLCAPP62952 87 aa15.23■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 HTD2P86397 168 aa15.23■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 C22orf42Q6IC83 251 aa15.23■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 OR8H3Q8N146 312 aa15.23■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 OR10X1Q8NGY0 326 aa15.23■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 CFHR4Q92496 578 aa15.23■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 PRSS22Q9GZN4 317 aa15.23■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 SERTAD4Q9NUC0 356 aa15.23■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 KCNIP1Q9NZI2 227 aa15.23■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa15.22■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa15.22■□□□□ 0.03
NISCH-209ENST00000485765 OR2F2O95006 317 aa15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms