RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	C15orf65	H3BRN8	121 aa		14.35	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	HAX1	O00165	279 aa		14.35	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		14.35	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	CEACAM3	P40198	252 aa		14.35	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	14.35	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	PLA2G7	Q13093	441 aa		14.35	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	AANAT	Q16613	207 aa		14.35	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		14.35	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		14.35	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	AWAT1	Q58HT5	328 aa		14.35	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	14.35	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		14.35	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		14.35	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		14.35	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		14.35	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	CENPO	Q9BU64	300 aa		14.35	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		14.35	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	PSG11	Q9UQ72	335 aa		14.35	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902		A0A1W2PPE3	182 aa		14.34	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		14.34	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902		J3QR06	171 aa		14.34	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	F2RL2	O00254	374 aa		14.34	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	IGLV1-47	P01700	117 aa		14.34	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	HBZ	P02008	142 aa		14.34	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	14.34	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	ARHGDIB	P52566	201 aa		14.34	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	RAG2	P55895	527 aa		14.34	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902		Q6ZTK2	550 aa		14.34	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	GAPT	Q8N292	157 aa		14.34	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		14.34	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		14.34	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	OR1L1	Q8NH94	360 aa		14.34	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	14.34	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		14.34	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	MMP28	Q9H239	520 aa		14.34	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		14.34	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	C1RL	Q9NZP8	487 aa		14.34	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	GNG12	Q9UBI6	72 aa		14.34	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		14.34	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	14.34	□□□□□ -0.11
USP19-210	ENST00000465902	LDLRAD4	O15165	306 aa		14.33	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	AIRE	O43918	545 aa		14.33	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		14.33	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	EFNB2	P52799	333 aa		14.33	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	14.33	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	14.33	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		14.33	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	OR4F5	Q8NH21	305 aa		14.33	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	AK3	Q9UIJ7	227 aa		14.33	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		14.32	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902		A0A075B6Q4	140 aa		14.32	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		14.32	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	VGLL3	A8MV65	326 aa		14.32	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	14.32	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	CFP	P27918	469 aa		14.32	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		14.32	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	14.32	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		14.32	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		14.32	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		14.32	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	RPE	Q96AT9	228 aa		14.32	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	YIPF6	Q96EC8	236 aa		14.32	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	PECR	Q9BY49	303 aa		14.32	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		14.32	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	14.32	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		14.32	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		14.32	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	HSF4	Q9ULV5	492 aa		14.32	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	RAB6A	P20340	208 aa		14.31	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	BRS3	P32247	399 aa		14.31	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	MNDA	P41218	407 aa		14.31	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	TMEM50B	P56557	158 aa		14.31	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	LOXL3	P58215	753 aa		14.31	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	14.31	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	RELB	Q01201	579 aa		14.31	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	MADCAM1	Q13477	382 aa		14.31	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	IDNK	Q5T6J7	187 aa		14.31	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		14.31	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	TMEM219	Q86XT9	240 aa		14.31	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	PIFO	Q8TCI5	191 aa		14.31	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	TOMM40L	Q969M1	308 aa		14.31	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	RAB3C	Q96E17	227 aa		14.31	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	14.31	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	14.31	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	14.31	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	BEX1	Q9HBH7	125 aa		14.31	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	RAB18	Q9NP72	206 aa		14.31	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		14.31	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		14.31	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		14.3	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	14.3	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	NDUFA7	O95182	113 aa		14.3	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	14.3	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	CD24	P25063	80 aa		14.3	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	TGFBR1	P36897	503 aa		14.3	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		14.3	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		14.3	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		14.3	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		14.3	□□□□□ -0.12
USP19-210	ENST00000465902	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		14.3	□□□□□ -0.12

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