RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415409.5

HDAC8-211, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC8, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-211ENST00000415409 SIX6O95475 246 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 CLDN14O95500 239 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 PPYP01298 95 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 S100A6P06703 90 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 PSG2P11465 335 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 HLA-GP17693 338 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 EGR1P18146 543 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 PI3P19957 117 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 C4BPBP20851 252 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 GNLYP22749 145 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 CD80P33681 288 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 RBMXP38159 391 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 OR3A1P47881 315 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 PIGPP57054 158 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 CCL8P80075 99 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 CYCSP99999 105 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 SLC9A3R2Q15599 337 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 EFNB3Q15768 340 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 KCNJ8Q15842 424 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 KRBOX4Q5JUW0 171 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 TRAT1Q6PIZ9 186 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 CLEC18BQ6UXF7 455 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 GSG1LQ6UXU4 331 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 Q6ZPA2 131 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 C1orf87Q8N0U7 546 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 CD177Q8N6Q3 437 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 OR5M8Q8NGP6 311 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM230Q96A57 120 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 SNX22Q96L94 193 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 CABLES2Q9BTV7 478 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 PDCD10Q9BUL8 212 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 RSRP1Q9BUV0 290 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 FXYD6Q9H0Q3 95 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 SAP30LQ9HAJ7 183 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 TAF9BQ9HBM6 251 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 RAB9BQ9NP90 201 aa5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 C5orf51A6NDU8 294 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 OOEPA6NGQ2 149 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 NKX6-3A6NJ46 265 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 MGST3O14880 152 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 SPINT2O43291 252 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 ATP6V1G1O75348 118 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 TUSC2O75896 110 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF205O95201 554 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 IFNA21P01568 189 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 IL2RGP31785 369 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 LUMP51884 338 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 PAX5Q02548 391 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 TFF3Q07654 80 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 AESQ08117 197 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 FGL1Q08830 312 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 HMGN3Q15651 99 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 C2orf68Q2NKX9 166 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 SPRNQ5BIV9 151 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 TEX36Q5VZQ5 186 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 CMTM1Q8IZ96 169 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 PRR18Q8N4B5 295 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF561Q8N587 486 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 OR5D13Q8NGL4 314 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 ANGPTL6Q8NI99 470 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 FAM222BQ8WU58 562 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 SECTM1Q8WVN6 248 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 IL1F10Q8WWZ1 152 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 NEUROG1Q92886 237 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 NINJ1Q92982 152 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 GALMQ96C23 342 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 SDSLQ96GA7 329 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 LURAP1Q96LR2 239 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 SUCNR1Q9BXA5 334 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 SLC5A7Q9GZV3 580 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 DNTTIP1Q9H147 329 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 LIME1Q9H400 295 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 NAA60Q9H7X0 242 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 RAB18Q9NP72 206 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 COMMD9Q9P000 198 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 PIPOXQ9P0Z9 390 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 KIF25Q9UIL4 384 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 OR2W1Q9Y3N9 320 aa5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
HDAC8-211ENST00000415409 ESPL1Q14674 2120 aa5.54□□□□□ -1.52
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