RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411249.1

RNU6-1199P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1199, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1199P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1199P-201ENST00000411249 MUC12Q9UKN1 5478 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 LOC100653049A0A140TA62 436 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 B4DEV8 164 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 DNAJB6O75190 326 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ZNF737O75373 536 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 KRT34O76011 436 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 NPPAP01160 153 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 LIPCP11150 499 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SLC2A1P11166 492 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CTSEP14091 401 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 PYCR1P32322 319 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CLDN18P56856 261 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 RAB2AP61019 212 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 RHOAP61586 193 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CEACAM16Q2WEN9 425 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 RASL11AQ6T310 242 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 LHFPL1Q86WI0 220 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 GATD1Q8NB37 220 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 OR51Q1Q8NH59 317 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 NELFBQ8WX92 580 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ASB17Q8WXJ9 295 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 MIEN1Q9BRT3 115 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SPRR2GQ9BYE4 73 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CHST5Q9GZS9 411 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 HPCAL4Q9UM19 191 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 FIS1Q9Y3D6 152 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ALG5Q9Y673 324 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 GATCO43716 136 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ENSAO43768 121 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 LTAP01374 205 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 KLK1P06870 262 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 P2RY2P41231 377 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 GABARAPL2P60520 117 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 LCN2P80188 198 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 PDK2Q15119 407 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 MAPK14Q16539 360 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CA13Q8N1Q1 262 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 NAT6Q93015 286 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 IL22Q9GZX6 179 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 C16orf95Q9H693 158 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CRLF2Q9HC73 371 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 NRBP2Q9NSY0 501 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 AHSPQ9NZD4 102 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SNX12Q9UMY4 172 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 MTCH2Q9Y6C9 303 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CACNA1BQ00975 2339 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1199P-201ENST00000411249 FREM1Q5H8C1 2179 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 A0A1B0GXF2 115 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 GRIFINA4D1Z8 144 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 GOLGA8TH3BQL2 631 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 I3L4J1 428 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 RPSAP08865 295 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 FBP1P09467 338 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ESDP10768 282 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CPN2P22792 545 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ARR3P36575 388 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 MP68P56378 58 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ULK3Q6PHR2 472 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CLEC20AQ6ZU45 233 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 DYNAPQ8N1N2 210 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 GAPTQ8N292 157 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 FAM19A2Q8N3H0 131 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 UPK3BQ9BT76 320 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 RAB20Q9NX57 234 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 MYO5BQ9ULV0 1848 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 LAMA4Q16363 1823 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 WRBO00258 174 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 FGF16O43320 207 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ZMPSTE24O75844 475 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 IGKV5-2P06315 115 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CRHBPP24387 322 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 REG1BP48304 166 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 HBG1P69891 147 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 HBG2P69892 147 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 GBE1Q04446 702 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 SLC35D2Q76EJ3 337 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 OFCC1Q8IZS5 231 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 C15orf53Q8NAA6 179 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-1199P-201ENST00000411249 CYGBQ8WWM9 190 aa-0.05□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms