RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366955.7

CENPF-201, Transcript of centromere protein F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CENPF, Length 10,307 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPF-201ENST00000366955 RAG2P55895 527 aa3.6□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 CLDN18P56856 261 aa3.6□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 FABP9Q0Z7S8 132 aa3.6□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 KIR3DL3Q8N743 410 aa3.6□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 LFNGQ8NES3 379 aa3.6□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 RCE1Q9Y256 329 aa3.6□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 ZNF727A8MUV8 499 aa3.6□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 PRSS23O95084 383 aa3.6□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 NKX2-2O95096 273 aa3.6□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 GASTP01350 101 aa3.6□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 WNT1P04628 370 aa3.6□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 COL8A1P27658 744 aa3.6□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa3.6□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 OVCH2Q7RTZ1 564 aa3.6□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 OR5A2Q8NGI9 324 aa3.6□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 OR4Q3Q8NH05 313 aa3.6□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 HIGD1AQ9Y241 93 aa3.6□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 GBF1Q92538 1859 aa3.6□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 OR2W5A6NFC9 320 aa3.6□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 CFDP00746 253 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 CTSLP07711 333 aa3.6□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 RPL32P62910 135 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 TWIST1Q15672 202 aa3.6□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 TMEM183BQ1AE95 376 aa3.6□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa3.6□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 CYS1Q717R9 158 aa3.6□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 MMP28Q9H239 520 aa3.6□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 PLAC1Q9HBJ0 212 aa3.6□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 SLC2A9Q9NRM0 540 aa3.6□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 CBY1Q9Y3M2 126 aa3.6□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 A6NJY4 79 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 PHOX2AO14813 284 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 MGMTP16455 207 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 GDNFP39905 211 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 NECAP1Q8NC96 275 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 BIRC8Q96P09 236 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 SMIM14Q96QK8 99 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 EDA2RQ9HAV5 297 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 NSG2Q9Y328 171 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 MMP24Q9Y5R2 645 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 PSME4Q14997 1843 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 A0A087WX48 190 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 FITM1A5D6W6 292 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 PSMB11A5LHX3 300 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 OR4C46A6NHA9 309 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 LYRM1O43325 122 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 CCL3P10147 92 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 APOC4P55056 127 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 SORDQ00796 357 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 VSTM2LQ96N03 204 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 HAPLN2Q9GZV7 340 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 H7C1H1 209 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 PMS2P11Q13670 270 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 TIMM23BQ5SRD1 257 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 ACP7Q6ZNF0 438 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 KCNK7Q9Y2U2 307 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 IGSF23A1L1A6 192 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 PTP4A3O75365 173 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 CEACAM4O75871 244 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 PATE4P0C8F1 98 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 SLC17A1Q14916 467 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 SIGLEC11Q96RL6 698 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 TMEM74BQ9NUR3 256 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 NINQ8N4C6 2090 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 DNAJC13O75165 2243 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 A0A1B0GUS0 222 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 NDUFS8O00217 210 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 SOX15O60248 233 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 CST4P01036 141 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 TEX30Q5JUR7 227 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 C10orf113Q5VZT2 155 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 PRNTQ86SH4 94 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 TEAD3Q99594 435 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 B9D1Q9UPM9 204 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 J3QR06 171 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 CIDEAO60543 219 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 EPPINO95925 133 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 DNAL4O96015 105 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 GATA3P23771 443 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 GSCP56915 257 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 SPINK9Q5DT21 86 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 Q6ZNB5 142 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 CLEC7AQ9BXN2 247 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
CENPF-201ENST00000366955 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa3.59□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms