RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 GPR137BO60478 399 aa17.98■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 RAB6AP20340 208 aa17.98■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 HTR1DP28221 377 aa17.98■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 RANBP1P43487 201 aa17.98■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 RAB13P51153 203 aa17.98■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 ACTG1P63261 375 aa17.98■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 MXD1Q05195 221 aa17.98■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa17.98■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 SFXN4Q6P4A7 337 aa17.98■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 ZNF880Q6PDB4 577 aa17.98■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa17.98■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 OR52M1Q8NGK5 317 aa17.98■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 OR13F1Q8NGS4 319 aa17.98■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 OR9G1Q8NH87 305 aa17.98■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 OR1L1Q8NH94 360 aa17.98■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 ZNF596Q8TC21 504 aa17.98■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 PTX4Q96A99 478 aa17.98■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa17.98■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 PECRQ9BY49 303 aa17.98■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 VPREB3Q9UKI3 123 aa17.98■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 HILPDAQ9Y5L2 63 aa17.98■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 ANK2Q01484 3957 aa17.98■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa17.98■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 RAB27BO00194 218 aa17.98■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 OLFML2AQ68BL7 652 aa17.98■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 Q6ZTK2 550 aa17.98■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 OR5R1Q8NH85 324 aa17.98■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 TAF9BQ9HBM6 251 aa17.98■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 C1RLQ9NZP8 487 aa17.98■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 DPM3Q9P2X0 92 aa17.98■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 AK3Q9UIJ7 227 aa17.98■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 DAPK2Q9UIK4 370 aa17.98■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 AIREO43918 545 aa17.97■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 HBZP02008 142 aa17.97■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 PLA1AQ53H76 456 aa17.97■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 C6orf183Q5T699 404 aa17.97■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 OR56B1Q8NGI3 324 aa17.97■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 NDNFQ8TB73 568 aa17.97■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 FUNDC2Q9BWH2 189 aa17.97■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 MMP28Q9H239 520 aa17.97■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 GFOD1Q9NXC2 390 aa17.97■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa17.96■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa17.96■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 TOR1AO14656 332 aa17.96■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 IGHV3-43DP0DP04 118 aa17.96■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 DYNLT3P51808 116 aa17.96■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 PRRX1P54821 245 aa17.96■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 LSM3P62310 102 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 FAM189A2Q15884 450 aa17.96■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa17.96■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 ZNF554Q86TJ5 538 aa17.96■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PPE3 182 aa17.95■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 ZNF134P52741 427 aa17.95■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 HMGN3Q15651 99 aa17.95■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 LY6EQ16553 131 aa17.95■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 TRAT1Q6PIZ9 186 aa17.95■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 ZNF439Q8NDP4 499 aa17.95■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 OR10R2Q8NGX6 335 aa17.95■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 LEUTXA8MZ59 168 aa17.94■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 TFAP2AP05549 437 aa17.94■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 RPS19P39019 145 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 GNG10P50151 68 aa17.94■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 RPL15P61313 204 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa17.94■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 AWAT1Q58HT5 328 aa17.94■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa17.94■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 PRR18Q8N4B5 295 aa17.94■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 LINC00311Q8N616 119 aa17.94■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 C8orf31Q8N9H6 132 aa17.94■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 OR5H6Q8NGV6 325 aa17.94■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 BTBD17A6NE02 478 aa17.93■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 SLC31A2O15432 143 aa17.93■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 SPINT2O43291 252 aa17.93■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 ALDH3B2P48448 385 aa17.93■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 FBLN7Q53RD9 439 aa17.93■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 LGALS14Q8TCE9 139 aa17.93■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 RAB3CQ96E17 227 aa17.93■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 A6NDX4 124 aa17.92■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 MFNGO00587 321 aa17.92■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 CHST1O43916 411 aa17.92■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 NDUFA7O95182 113 aa17.92■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 FOXL1Q12952 345 aa17.92■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 Q3ZCU0 254 aa17.92■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 Q6ZSV7 163 aa17.92■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 OR52L2PQ8NGH6 319 aa17.92■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 CREB3L1Q96BA8 519 aa17.92■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 KCNIP1Q9NZI2 227 aa17.92■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 TCF19Q9Y242 345 aa17.92■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 GNB3P16520 340 aa17.91■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 MDKP21741 143 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 NCS1P62166 190 aa17.91■□□□□ 0.46
SYF2-201ENST00000236273 HTD2P86397 168 aa17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms